Protein–RNA interactions for Protein: Q14397

GCKR, Glucokinase regulatory protein, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCKRQ14397 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GCKRQ14397 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GCKRQ14397 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
GCKRQ14397 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GCKRQ14397 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GCKRQ14397 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GCKRQ14397 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GCKRQ14397 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GCKRQ14397 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
GCKRQ14397 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GCKRQ14397 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
GCKRQ14397 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GCKRQ14397 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GCKRQ14397 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GCKRQ14397 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GCKRQ14397 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GCKRQ14397 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GCKRQ14397 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GCKRQ14397 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GCKRQ14397 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GCKRQ14397 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GCKRQ14397 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GCKRQ14397 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GCKRQ14397 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GCKRQ14397 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GCKRQ14397 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GCKRQ14397 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
GCKRQ14397 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GCKRQ14397 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
GCKRQ14397 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
GCKRQ14397 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
GCKRQ14397 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GCKRQ14397 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GCKRQ14397 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GCKRQ14397 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
GCKRQ14397 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GCKRQ14397 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GCKRQ14397 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GCKRQ14397 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GCKRQ14397 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GCKRQ14397 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GCKRQ14397 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GCKRQ14397 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GCKRQ14397 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GCKRQ14397 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GCKRQ14397 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GCKRQ14397 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
GCKRQ14397 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GCKRQ14397 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GCKRQ14397 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
GCKRQ14397 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GCKRQ14397 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GCKRQ14397 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
GCKRQ14397 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GCKRQ14397 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
GCKRQ14397 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GCKRQ14397 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GCKRQ14397 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GCKRQ14397 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GCKRQ14397 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GCKRQ14397 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GCKRQ14397 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GCKRQ14397 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GCKRQ14397 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GCKRQ14397 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GCKRQ14397 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GCKRQ14397 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GCKRQ14397 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GCKRQ14397 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GCKRQ14397 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GCKRQ14397 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GCKRQ14397 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GCKRQ14397 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GCKRQ14397 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GCKRQ14397 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GCKRQ14397 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GCKRQ14397 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GCKRQ14397 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GCKRQ14397 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GCKRQ14397 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GCKRQ14397 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GCKRQ14397 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GCKRQ14397 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GCKRQ14397 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GCKRQ14397 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GCKRQ14397 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GCKRQ14397 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GCKRQ14397 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GCKRQ14397 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GCKRQ14397 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
GCKRQ14397 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GCKRQ14397 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GCKRQ14397 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GCKRQ14397 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GCKRQ14397 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GCKRQ14397 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GCKRQ14397 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GCKRQ14397 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GCKRQ14397 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GCKRQ14397 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms