Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPIDRQ14159 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPIDRQ14159 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SPIDRQ14159 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPIDRQ14159 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SPIDRQ14159 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPIDRQ14159 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPIDRQ14159 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPIDRQ14159 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPIDRQ14159 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPIDRQ14159 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPIDRQ14159 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SPIDRQ14159 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SPIDRQ14159 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPIDRQ14159 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SPIDRQ14159 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SPIDRQ14159 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPIDRQ14159 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPIDRQ14159 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPIDRQ14159 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPIDRQ14159 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPIDRQ14159 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPIDRQ14159 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPIDRQ14159 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPIDRQ14159 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPIDRQ14159 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPIDRQ14159 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SPIDRQ14159 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPIDRQ14159 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPIDRQ14159 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SPIDRQ14159 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPIDRQ14159 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPIDRQ14159 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPIDRQ14159 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPIDRQ14159 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPIDRQ14159 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPIDRQ14159 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPIDRQ14159 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPIDRQ14159 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPIDRQ14159 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPIDRQ14159 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SPIDRQ14159 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPIDRQ14159 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPIDRQ14159 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPIDRQ14159 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPIDRQ14159 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPIDRQ14159 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPIDRQ14159 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPIDRQ14159 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPIDRQ14159 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SPIDRQ14159 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPIDRQ14159 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPIDRQ14159 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPIDRQ14159 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPIDRQ14159 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPIDRQ14159 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPIDRQ14159 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPIDRQ14159 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPIDRQ14159 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPIDRQ14159 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPIDRQ14159 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPIDRQ14159 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPIDRQ14159 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPIDRQ14159 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SPIDRQ14159 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPIDRQ14159 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPIDRQ14159 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPIDRQ14159 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPIDRQ14159 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPIDRQ14159 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPIDRQ14159 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPIDRQ14159 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPIDRQ14159 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPIDRQ14159 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPIDRQ14159 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPIDRQ14159 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPIDRQ14159 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPIDRQ14159 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPIDRQ14159 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPIDRQ14159 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPIDRQ14159 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPIDRQ14159 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPIDRQ14159 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPIDRQ14159 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SPIDRQ14159 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPIDRQ14159 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPIDRQ14159 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPIDRQ14159 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPIDRQ14159 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPIDRQ14159 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPIDRQ14159 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPIDRQ14159 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPIDRQ14159 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SPIDRQ14159 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPIDRQ14159 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SPIDRQ14159 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPIDRQ14159 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPIDRQ14159 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPIDRQ14159 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SPIDRQ14159 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms