Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CDK13Q14004 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CDK13Q14004 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
CDK13Q14004 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
CDK13Q14004 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC35.19■■■■□ 3.22
CDK13Q14004 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CDK13Q14004 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
CDK13Q14004 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CDK13Q14004 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CDK13Q14004 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CDK13Q14004 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CDK13Q14004 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CDK13Q14004 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CDK13Q14004 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CDK13Q14004 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CDK13Q14004 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CDK13Q14004 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CDK13Q14004 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
CDK13Q14004 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CDK13Q14004 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CDK13Q14004 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CDK13Q14004 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CDK13Q14004 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CDK13Q14004 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CDK13Q14004 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
CDK13Q14004 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CDK13Q14004 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CDK13Q14004 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CDK13Q14004 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CDK13Q14004 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CDK13Q14004 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CDK13Q14004 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CDK13Q14004 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CDK13Q14004 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
CDK13Q14004 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CDK13Q14004 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CDK13Q14004 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CDK13Q14004 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CDK13Q14004 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CDK13Q14004 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CDK13Q14004 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CDK13Q14004 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CDK13Q14004 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CDK13Q14004 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CDK13Q14004 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CDK13Q14004 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CDK13Q14004 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CDK13Q14004 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CDK13Q14004 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
CDK13Q14004 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CDK13Q14004 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CDK13Q14004 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CDK13Q14004 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CDK13Q14004 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CDK13Q14004 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CDK13Q14004 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CDK13Q14004 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CDK13Q14004 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CDK13Q14004 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CDK13Q14004 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CDK13Q14004 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
CDK13Q14004 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CDK13Q14004 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CDK13Q14004 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CDK13Q14004 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CDK13Q14004 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CDK13Q14004 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CDK13Q14004 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CDK13Q14004 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CDK13Q14004 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CDK13Q14004 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CDK13Q14004 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CDK13Q14004 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CDK13Q14004 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CDK13Q14004 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CDK13Q14004 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CDK13Q14004 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CDK13Q14004 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CDK13Q14004 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CDK13Q14004 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
CDK13Q14004 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CDK13Q14004 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CDK13Q14004 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CDK13Q14004 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CDK13Q14004 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CDK13Q14004 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CDK13Q14004 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CDK13Q14004 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CDK13Q14004 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
CDK13Q14004 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.21
CDK13Q14004 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.21
CDK13Q14004 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
CDK13Q14004 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
CDK13Q14004 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
CDK13Q14004 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
CDK13Q14004 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.21
CDK13Q14004 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
CDK13Q14004 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CDK13Q14004 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CDK13Q14004 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
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