Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MKRN4PQ13434 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
MKRN4PQ13434 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MKRN4PQ13434 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MKRN4PQ13434 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MKRN4PQ13434 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MKRN4PQ13434 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MKRN4PQ13434 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MKRN4PQ13434 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MKRN4PQ13434 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MKRN4PQ13434 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MKRN4PQ13434 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MKRN4PQ13434 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MKRN4PQ13434 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MKRN4PQ13434 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MKRN4PQ13434 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MKRN4PQ13434 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MKRN4PQ13434 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MKRN4PQ13434 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MKRN4PQ13434 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MKRN4PQ13434 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MKRN4PQ13434 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MKRN4PQ13434 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MKRN4PQ13434 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MKRN4PQ13434 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MKRN4PQ13434 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MKRN4PQ13434 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MKRN4PQ13434 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MKRN4PQ13434 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MKRN4PQ13434 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
MKRN4PQ13434 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MKRN4PQ13434 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
MKRN4PQ13434 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MKRN4PQ13434 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MKRN4PQ13434 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MKRN4PQ13434 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MKRN4PQ13434 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MKRN4PQ13434 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MKRN4PQ13434 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MKRN4PQ13434 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MKRN4PQ13434 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MKRN4PQ13434 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MKRN4PQ13434 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MKRN4PQ13434 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MKRN4PQ13434 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MKRN4PQ13434 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MKRN4PQ13434 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MKRN4PQ13434 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MKRN4PQ13434 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MKRN4PQ13434 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MKRN4PQ13434 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MKRN4PQ13434 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
MKRN4PQ13434 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MKRN4PQ13434 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MKRN4PQ13434 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MKRN4PQ13434 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MKRN4PQ13434 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MKRN4PQ13434 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MKRN4PQ13434 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MKRN4PQ13434 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MKRN4PQ13434 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
MKRN4PQ13434 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MKRN4PQ13434 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
MKRN4PQ13434 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MKRN4PQ13434 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MKRN4PQ13434 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
MKRN4PQ13434 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MKRN4PQ13434 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
MKRN4PQ13434 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MKRN4PQ13434 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MKRN4PQ13434 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MKRN4PQ13434 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MKRN4PQ13434 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MKRN4PQ13434 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MKRN4PQ13434 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MKRN4PQ13434 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MKRN4PQ13434 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MKRN4PQ13434 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MKRN4PQ13434 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MKRN4PQ13434 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
MKRN4PQ13434 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MKRN4PQ13434 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MKRN4PQ13434 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MKRN4PQ13434 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MKRN4PQ13434 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MKRN4PQ13434 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MKRN4PQ13434 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MKRN4PQ13434 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MKRN4PQ13434 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MKRN4PQ13434 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
MKRN4PQ13434 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MKRN4PQ13434 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MKRN4PQ13434 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MKRN4PQ13434 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MKRN4PQ13434 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MKRN4PQ13434 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MKRN4PQ13434 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
MKRN4PQ13434 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MKRN4PQ13434 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MKRN4PQ13434 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
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