Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKP2Q13309 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKP2Q13309 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKP2Q13309 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SKP2Q13309 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKP2Q13309 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKP2Q13309 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SKP2Q13309 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKP2Q13309 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKP2Q13309 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKP2Q13309 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKP2Q13309 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKP2Q13309 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKP2Q13309 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKP2Q13309 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKP2Q13309 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SKP2Q13309 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SKP2Q13309 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SKP2Q13309 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SKP2Q13309 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SKP2Q13309 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SKP2Q13309 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SKP2Q13309 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SKP2Q13309 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKP2Q13309 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKP2Q13309 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKP2Q13309 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKP2Q13309 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SKP2Q13309 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKP2Q13309 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKP2Q13309 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKP2Q13309 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKP2Q13309 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKP2Q13309 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SKP2Q13309 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SKP2Q13309 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SKP2Q13309 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SKP2Q13309 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SKP2Q13309 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SKP2Q13309 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SKP2Q13309 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SKP2Q13309 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SKP2Q13309 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SKP2Q13309 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SKP2Q13309 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SKP2Q13309 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SKP2Q13309 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SKP2Q13309 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SKP2Q13309 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SKP2Q13309 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SKP2Q13309 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKP2Q13309 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKP2Q13309 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKP2Q13309 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKP2Q13309 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SKP2Q13309 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKP2Q13309 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKP2Q13309 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKP2Q13309 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKP2Q13309 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKP2Q13309 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKP2Q13309 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKP2Q13309 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKP2Q13309 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKP2Q13309 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKP2Q13309 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SKP2Q13309 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SKP2Q13309 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SKP2Q13309 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SKP2Q13309 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SKP2Q13309 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SKP2Q13309 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SKP2Q13309 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SKP2Q13309 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SKP2Q13309 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SKP2Q13309 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SKP2Q13309 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SKP2Q13309 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SKP2Q13309 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SKP2Q13309 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SKP2Q13309 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKP2Q13309 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKP2Q13309 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKP2Q13309 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKP2Q13309 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKP2Q13309 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKP2Q13309 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKP2Q13309 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKP2Q13309 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKP2Q13309 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKP2Q13309 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SKP2Q13309 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKP2Q13309 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKP2Q13309 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKP2Q13309 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKP2Q13309 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKP2Q13309 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKP2Q13309 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKP2Q13309 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKP2Q13309 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
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