Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BNIP1Q12981 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BNIP1Q12981 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BNIP1Q12981 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BNIP1Q12981 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BNIP1Q12981 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BNIP1Q12981 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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BNIP1Q12981 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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BNIP1Q12981 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BNIP1Q12981 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BNIP1Q12981 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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BNIP1Q12981 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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BNIP1Q12981 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BNIP1Q12981 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BNIP1Q12981 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BNIP1Q12981 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BNIP1Q12981 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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BNIP1Q12981 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BNIP1Q12981 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BNIP1Q12981 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BNIP1Q12981 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
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BNIP1Q12981 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BNIP1Q12981 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BNIP1Q12981 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BNIP1Q12981 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BNIP1Q12981 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BNIP1Q12981 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BNIP1Q12981 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BNIP1Q12981 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BNIP1Q12981 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BNIP1Q12981 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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BNIP1Q12981 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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BNIP1Q12981 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BNIP1Q12981 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BNIP1Q12981 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BNIP1Q12981 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BNIP1Q12981 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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BNIP1Q12981 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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BNIP1Q12981 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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BNIP1Q12981 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BNIP1Q12981 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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BNIP1Q12981 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BNIP1Q12981 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BNIP1Q12981 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BNIP1Q12981 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BNIP1Q12981 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BNIP1Q12981 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BNIP1Q12981 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BNIP1Q12981 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BNIP1Q12981 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BNIP1Q12981 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BNIP1Q12981 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BNIP1Q12981 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BNIP1Q12981 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BNIP1Q12981 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BNIP1Q12981 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BNIP1Q12981 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BNIP1Q12981 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
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