Protein–RNA interactions for Protein: Q12193

TY1B-BR, Transposon Ty1-BR Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,756 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-BRQ12193 SKP2YNL311C 2292 nt5.77□□□□□ -1.49
TY1B-BRQ12193 MTD1YKR080W 963 nt5.76□□□□□ -1.49
TY1B-BRQ12193 YPL041CYPL041C 624 nt5.76□□□□□ -1.49
TY1B-BRQ12193 EMP47YFL048C 1338 nt5.76□□□□□ -1.49
TY1B-BRQ12193 UPC2YDR213W 2742 nt5.76□□□□□ -1.49
TY1B-BRQ12193 YMR114CYMR114C 1107 nt5.75□□□□□ -1.49
TY1B-BRQ12193 YBR056W-AYBR056W-A 201 nt5.75□□□□□ -1.49
TY1B-BRQ12193 EFM2YBR271W 1260 nt5.75□□□□□ -1.49
TY1B-BRQ12193 NOC4YPR144C 1659 nt5.75□□□□□ -1.49
TY1B-BRQ12193 ERG5YMR015C 1617 nt5.75□□□□□ -1.49
TY1B-BRQ12193 HOS2YGL194C 1359 nt5.75□□□□□ -1.49
TY1B-BRQ12193 YDL121CYDL121C 450 nt5.75□□□□□ -1.49
TY1B-BRQ12193 IMP2YMR035W 534 nt5.75□□□□□ -1.49
TY1B-BRQ12193 POP4YBR257W 840 nt5.75□□□□□ -1.49
TY1B-BRQ12193 UBP9YER098W 2265 nt5.74□□□□□ -1.49
TY1B-BRQ12193 TFC7YOR110W 1308 nt5.74□□□□□ -1.49
TY1B-BRQ12193 YGL041W-AYGL041W-A 465 nt5.73□□□□□ -1.49
TY1B-BRQ12193 YAL064W-BYAL064W-B 381 nt5.73□□□□□ -1.49
TY1B-BRQ12193 FAT1YBR041W 2010 nt5.73□□□□□ -1.49
TY1B-BRQ12193 CHL1YPL008W 2586 nt5.73□□□□□ -1.49
TY1B-BRQ12193 EHD3YDR036C 1503 nt5.73□□□□□ -1.49
TY1B-BRQ12193 OPT1YJL212C 2400 nt5.73□□□□□ -1.49
TY1B-BRQ12193 YHR112CYHR112C 1137 nt5.72□□□□□ -1.49
TY1B-BRQ12193 OPY2YPR075C 1083 nt5.72□□□□□ -1.49
TY1B-BRQ12193 RDS1YCR106W 2499 nt5.72□□□□□ -1.49
TY1B-BRQ12193 HOYDL227C 1761 nt5.72□□□□□ -1.49
TY1B-BRQ12193 RPG1YBR079C 2895 nt5.72□□□□□ -1.49
TY1B-BRQ12193 PAU10YDR542W 363 nt5.72□□□□□ -1.49
TY1B-BRQ12193 RMR1YGL250W 726 nt5.72□□□□□ -1.49
TY1B-BRQ12193 PAU11YGL261C 363 nt5.72□□□□□ -1.49
TY1B-BRQ12193 PAU13YHL046C 363 nt5.72□□□□□ -1.49
TY1B-BRQ12193 PAU4YLR461W 363 nt5.72□□□□□ -1.49
TY1B-BRQ12193 HMG1YML075C 3165 nt5.72□□□□□ -1.49
TY1B-BRQ12193 VID22YLR373C 2706 nt5.72□□□□□ -1.49
TY1B-BRQ12193 DBP10YDL031W 2988 nt5.71□□□□□ -1.49
TY1B-BRQ12193 YEL057CYEL057C 702 nt5.71□□□□□ -1.5
TY1B-BRQ12193 TPA1YER049W 1935 nt5.71□□□□□ -1.5
TY1B-BRQ12193 HRK1YOR267C 2280 nt5.7□□□□□ -1.5
TY1B-BRQ12193 ECT1YGR007W 972 nt5.7□□□□□ -1.5
TY1B-BRQ12193 RIB4YOL143C 510 nt5.7□□□□□ -1.5
TY1B-BRQ12193 GLT1YDL171C 6438 nt5.7□□□□□ -1.5
TY1B-BRQ12193 FRE3YOR381W 2136 nt5.7□□□□□ -1.5
TY1B-BRQ12193 GCD14YJL125C 1152 nt5.7□□□□□ -1.5
TY1B-BRQ12193 MYO5YMR109W 3660 nt5.69□□□□□ -1.5
TY1B-BRQ12193 VHS3YOR054C 2025 nt5.69□□□□□ -1.5
TY1B-BRQ12193 SWH1YAR042W 3567 nt5.69□□□□□ -1.5
TY1B-BRQ12193 YEL045CYEL045C 426 nt5.69□□□□□ -1.5
TY1B-BRQ12193 HUT1YPL244C 1020 nt5.69□□□□□ -1.5
TY1B-BRQ12193 RKM2YDR198C 1440 nt5.68□□□□□ -1.5
TY1B-BRQ12193 YDR306CYDR306C 1437 nt5.68□□□□□ -1.5
TY1B-BRQ12193 NBP2YDR162C 711 nt5.67□□□□□ -1.5
TY1B-BRQ12193 MDJ2YNL328C 441 nt5.67□□□□□ -1.5
TY1B-BRQ12193 NUG1YER006W 1563 nt5.67□□□□□ -1.5
TY1B-BRQ12193 OCA2YNL056W 594 nt5.67□□□□□ -1.5
TY1B-BRQ12193 TOG1YER184C 2385 nt5.66□□□□□ -1.5
TY1B-BRQ12193 ROG3YFR022W 2202 nt5.66□□□□□ -1.5
TY1B-BRQ12193 YMR122W-AYMR122W-A 255 nt5.66□□□□□ -1.5
TY1B-BRQ12193 COX11YPL132W 903 nt5.65□□□□□ -1.5
TY1B-BRQ12193 PMT2YAL023C 2280 nt5.65□□□□□ -1.51
TY1B-BRQ12193 ELF1YKL160W 438 nt5.65□□□□□ -1.51
TY1B-BRQ12193 AHP1YLR109W 531 nt5.65□□□□□ -1.51
TY1B-BRQ12193 YPL025CYPL025C 558 nt5.65□□□□□ -1.51
TY1B-BRQ12193 CST6YIL036W 1764 nt5.64□□□□□ -1.51
TY1B-BRQ12193 snR7-LsnR7-L 214 nt5.64□□□□□ -1.51
TY1B-BRQ12193 ECM8YBR076W 1065 nt5.64□□□□□ -1.51
TY1B-BRQ12193 JIP4YDR475C 2631 nt5.64□□□□□ -1.51
TY1B-BRQ12193 NSI1YDR026C 1713 nt5.63□□□□□ -1.51
TY1B-BRQ12193 PMT6YGR199W 2280 nt5.63□□□□□ -1.51
TY1B-BRQ12193 OPI6YDL096C 327 nt5.63□□□□□ -1.51
TY1B-BRQ12193 IRC25YLR021W 540 nt5.63□□□□□ -1.51
TY1B-BRQ12193 MOH1YBL049W 417 nt5.63□□□□□ -1.51
TY1B-BRQ12193 COG5YNL051W 1212 nt5.63□□□□□ -1.51
TY1B-BRQ12193 PDR16YNL231C 1056 nt5.63□□□□□ -1.51
TY1B-BRQ12193 RFC3YNL290W 1023 nt5.63□□□□□ -1.51
TY1B-BRQ12193 DBF4YDR052C 2115 nt5.63□□□□□ -1.51
TY1B-BRQ12193 MTC4YBR255W 2085 nt5.63□□□□□ -1.51
TY1B-BRQ12193 RRN3YKL125W 1884 nt5.62□□□□□ -1.51
TY1B-BRQ12193 PTM1YKL039W 1572 nt5.62□□□□□ -1.51
TY1B-BRQ12193 FDH1YOR388C 1131 nt5.62□□□□□ -1.51
TY1B-BRQ12193 NCR1YPL006W 3513 nt5.62□□□□□ -1.51
TY1B-BRQ12193 FDH2YPL275W 711 nt5.62□□□□□ -1.51
TY1B-BRQ12193 SPT10YJL127C 1923 nt5.61□□□□□ -1.51
TY1B-BRQ12193 PHO84YML123C 1764 nt5.61□□□□□ -1.51
TY1B-BRQ12193 DSF2YBR007C 2211 nt5.61□□□□□ -1.51
TY1B-BRQ12193 URA3YEL021W 804 nt5.61□□□□□ -1.51
TY1B-BRQ12193 PHA2YNL316C 1005 nt5.61□□□□□ -1.51
TY1B-BRQ12193 OSW1YOR255W 837 nt5.61□□□□□ -1.51
TY1B-BRQ12193 YGR139WYGR139W 339 nt5.6□□□□□ -1.51
TY1B-BRQ12193 ECM4YKR076W 1113 nt5.6□□□□□ -1.51
TY1B-BRQ12193 ACK1YDL203C 1872 nt5.6□□□□□ -1.51
TY1B-BRQ12193 STE13YOR219C 2796 nt5.6□□□□□ -1.51
TY1B-BRQ12193 DTD1YDL219W 453 nt5.6□□□□□ -1.51
TY1B-BRQ12193 YLR012CYLR012C 300 nt5.6□□□□□ -1.51
TY1B-BRQ12193 SIW14YNL032W 846 nt5.6□□□□□ -1.51
TY1B-BRQ12193 YER076CYER076C 909 nt5.59□□□□□ -1.51
TY1B-BRQ12193 CDC45YLR103C 1953 nt5.59□□□□□ -1.51
TY1B-BRQ12193 ISR1YPR106W 1332 nt5.58□□□□□ -1.52
TY1B-BRQ12193 MSC7YHR039C 1935 nt5.58□□□□□ -1.52
TY1B-BRQ12193 RRN6YBL014C 2685 nt5.58□□□□□ -1.52
TY1B-BRQ12193 YPP1YGR198W 2454 nt5.58□□□□□ -1.52
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