Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NIPAL4Q0D2K0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NIPAL4Q0D2K0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NIPAL4Q0D2K0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NIPAL4Q0D2K0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NIPAL4Q0D2K0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NIPAL4Q0D2K0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NIPAL4Q0D2K0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NIPAL4Q0D2K0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NIPAL4Q0D2K0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NIPAL4Q0D2K0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NIPAL4Q0D2K0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NIPAL4Q0D2K0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NIPAL4Q0D2K0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NIPAL4Q0D2K0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NIPAL4Q0D2K0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NIPAL4Q0D2K0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NIPAL4Q0D2K0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NIPAL4Q0D2K0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NIPAL4Q0D2K0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NIPAL4Q0D2K0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NIPAL4Q0D2K0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NIPAL4Q0D2K0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NIPAL4Q0D2K0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NIPAL4Q0D2K0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NIPAL4Q0D2K0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NIPAL4Q0D2K0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NIPAL4Q0D2K0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NIPAL4Q0D2K0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NIPAL4Q0D2K0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NIPAL4Q0D2K0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NIPAL4Q0D2K0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NIPAL4Q0D2K0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NIPAL4Q0D2K0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NIPAL4Q0D2K0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NIPAL4Q0D2K0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NIPAL4Q0D2K0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NIPAL4Q0D2K0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NIPAL4Q0D2K0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NIPAL4Q0D2K0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NIPAL4Q0D2K0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NIPAL4Q0D2K0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NIPAL4Q0D2K0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NIPAL4Q0D2K0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NIPAL4Q0D2K0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NIPAL4Q0D2K0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NIPAL4Q0D2K0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NIPAL4Q0D2K0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NIPAL4Q0D2K0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NIPAL4Q0D2K0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NIPAL4Q0D2K0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NIPAL4Q0D2K0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NIPAL4Q0D2K0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NIPAL4Q0D2K0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NIPAL4Q0D2K0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NIPAL4Q0D2K0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NIPAL4Q0D2K0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NIPAL4Q0D2K0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NIPAL4Q0D2K0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NIPAL4Q0D2K0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NIPAL4Q0D2K0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NIPAL4Q0D2K0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NIPAL4Q0D2K0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIPAL4Q0D2K0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIPAL4Q0D2K0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIPAL4Q0D2K0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIPAL4Q0D2K0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIPAL4Q0D2K0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIPAL4Q0D2K0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIPAL4Q0D2K0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIPAL4Q0D2K0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIPAL4Q0D2K0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIPAL4Q0D2K0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIPAL4Q0D2K0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NIPAL4Q0D2K0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NIPAL4Q0D2K0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NIPAL4Q0D2K0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NIPAL4Q0D2K0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NIPAL4Q0D2K0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NIPAL4Q0D2K0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NIPAL4Q0D2K0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NIPAL4Q0D2K0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NIPAL4Q0D2K0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NIPAL4Q0D2K0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NIPAL4Q0D2K0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NIPAL4Q0D2K0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NIPAL4Q0D2K0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NIPAL4Q0D2K0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NIPAL4Q0D2K0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NIPAL4Q0D2K0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NIPAL4Q0D2K0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NIPAL4Q0D2K0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NIPAL4Q0D2K0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NIPAL4Q0D2K0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NIPAL4Q0D2K0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NIPAL4Q0D2K0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NIPAL4Q0D2K0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NIPAL4Q0D2K0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NIPAL4Q0D2K0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NIPAL4Q0D2K0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms