Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFFO1Q0D2I5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFFO1Q0D2I5 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFFO1Q0D2I5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFFO1Q0D2I5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFFO1Q0D2I5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFFO1Q0D2I5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IFFO1Q0D2I5 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IFFO1Q0D2I5 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23■■□□□ 1.27
IFFO1Q0D2I5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IFFO1Q0D2I5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IFFO1Q0D2I5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IFFO1Q0D2I5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IFFO1Q0D2I5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IFFO1Q0D2I5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
IFFO1Q0D2I5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23■■□□□ 1.27
IFFO1Q0D2I5 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IFFO1Q0D2I5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
IFFO1Q0D2I5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IFFO1Q0D2I5 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFFO1Q0D2I5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
IFFO1Q0D2I5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFFO1Q0D2I5 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFFO1Q0D2I5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFFO1Q0D2I5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
IFFO1Q0D2I5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFFO1Q0D2I5 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFFO1Q0D2I5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFFO1Q0D2I5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFFO1Q0D2I5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFFO1Q0D2I5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFFO1Q0D2I5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFFO1Q0D2I5 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFFO1Q0D2I5 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFFO1Q0D2I5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFFO1Q0D2I5 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFFO1Q0D2I5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFFO1Q0D2I5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFFO1Q0D2I5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFFO1Q0D2I5 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFFO1Q0D2I5 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFFO1Q0D2I5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFFO1Q0D2I5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFFO1Q0D2I5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFFO1Q0D2I5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFFO1Q0D2I5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFFO1Q0D2I5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFFO1Q0D2I5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFFO1Q0D2I5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFFO1Q0D2I5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFFO1Q0D2I5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFFO1Q0D2I5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFFO1Q0D2I5 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFFO1Q0D2I5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFFO1Q0D2I5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFFO1Q0D2I5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFFO1Q0D2I5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFFO1Q0D2I5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFFO1Q0D2I5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFFO1Q0D2I5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
IFFO1Q0D2I5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFFO1Q0D2I5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFFO1Q0D2I5 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFFO1Q0D2I5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFFO1Q0D2I5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFFO1Q0D2I5 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFFO1Q0D2I5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFFO1Q0D2I5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFFO1Q0D2I5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFFO1Q0D2I5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFFO1Q0D2I5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFFO1Q0D2I5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFFO1Q0D2I5 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFFO1Q0D2I5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFFO1Q0D2I5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFFO1Q0D2I5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFFO1Q0D2I5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFFO1Q0D2I5 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFFO1Q0D2I5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFFO1Q0D2I5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFFO1Q0D2I5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFFO1Q0D2I5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFFO1Q0D2I5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFFO1Q0D2I5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFFO1Q0D2I5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFFO1Q0D2I5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFFO1Q0D2I5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFFO1Q0D2I5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFFO1Q0D2I5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFFO1Q0D2I5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFFO1Q0D2I5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFFO1Q0D2I5 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFFO1Q0D2I5 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFFO1Q0D2I5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFFO1Q0D2I5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFFO1Q0D2I5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFFO1Q0D2I5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFFO1Q0D2I5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFFO1Q0D2I5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFFO1Q0D2I5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms