Protein–RNA interactions for Protein: Q07960

ARHGAP1, Rho GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP1Q07960 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ARHGAP1Q07960 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ARHGAP1Q07960 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ARHGAP1Q07960 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ARHGAP1Q07960 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ARHGAP1Q07960 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ARHGAP1Q07960 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARHGAP1Q07960 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARHGAP1Q07960 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARHGAP1Q07960 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARHGAP1Q07960 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARHGAP1Q07960 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARHGAP1Q07960 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ARHGAP1Q07960 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARHGAP1Q07960 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARHGAP1Q07960 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARHGAP1Q07960 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ARHGAP1Q07960 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARHGAP1Q07960 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARHGAP1Q07960 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARHGAP1Q07960 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARHGAP1Q07960 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARHGAP1Q07960 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARHGAP1Q07960 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARHGAP1Q07960 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARHGAP1Q07960 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARHGAP1Q07960 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARHGAP1Q07960 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARHGAP1Q07960 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARHGAP1Q07960 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARHGAP1Q07960 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARHGAP1Q07960 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARHGAP1Q07960 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARHGAP1Q07960 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARHGAP1Q07960 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARHGAP1Q07960 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARHGAP1Q07960 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARHGAP1Q07960 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARHGAP1Q07960 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARHGAP1Q07960 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARHGAP1Q07960 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ARHGAP1Q07960 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARHGAP1Q07960 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARHGAP1Q07960 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARHGAP1Q07960 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARHGAP1Q07960 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ARHGAP1Q07960 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARHGAP1Q07960 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARHGAP1Q07960 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ARHGAP1Q07960 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARHGAP1Q07960 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARHGAP1Q07960 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARHGAP1Q07960 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARHGAP1Q07960 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARHGAP1Q07960 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARHGAP1Q07960 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARHGAP1Q07960 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARHGAP1Q07960 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARHGAP1Q07960 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARHGAP1Q07960 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARHGAP1Q07960 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARHGAP1Q07960 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARHGAP1Q07960 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ARHGAP1Q07960 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARHGAP1Q07960 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARHGAP1Q07960 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARHGAP1Q07960 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARHGAP1Q07960 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARHGAP1Q07960 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ARHGAP1Q07960 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
ARHGAP1Q07960 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ARHGAP1Q07960 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ARHGAP1Q07960 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ARHGAP1Q07960 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGAP1Q07960 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGAP1Q07960 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGAP1Q07960 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGAP1Q07960 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGAP1Q07960 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGAP1Q07960 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARHGAP1Q07960 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARHGAP1Q07960 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARHGAP1Q07960 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARHGAP1Q07960 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARHGAP1Q07960 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARHGAP1Q07960 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARHGAP1Q07960 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARHGAP1Q07960 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ARHGAP1Q07960 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARHGAP1Q07960 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARHGAP1Q07960 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARHGAP1Q07960 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARHGAP1Q07960 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARHGAP1Q07960 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ARHGAP1Q07960 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGAP1Q07960 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGAP1Q07960 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGAP1Q07960 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGAP1Q07960 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGAP1Q07960 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms