Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms