Protein–RNA interactions for Protein: Q07457

BRE1, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BRE1Q07457 PFA4YOL003C 1137 nt5.51□□□□□ -1.53
BRE1Q07457 COX11YPL132W 903 nt5.51□□□□□ -1.53
BRE1Q07457 SET6YPL165C 1122 nt5.51□□□□□ -1.53
BRE1Q07457 SUL2YLR092W 2682 nt5.51□□□□□ -1.53
BRE1Q07457 YMR196WYMR196W 3267 nt5.5□□□□□ -1.53
BRE1Q07457 EMP46YLR080W 1335 nt5.5□□□□□ -1.53
BRE1Q07457 GGA1YDR358W 1674 nt5.5□□□□□ -1.53
BRE1Q07457 FMP30YPL103C 1407 nt5.5□□□□□ -1.53
BRE1Q07457 LAS21YJL062W 2493 nt5.5□□□□□ -1.53
BRE1Q07457 DAS2YDR020C 699 nt5.5□□□□□ -1.53
BRE1Q07457 MAP2YBL091C 1266 nt5.5□□□□□ -1.53
BRE1Q07457 AIF1YNR074C 1137 nt5.5□□□□□ -1.53
BRE1Q07457 YPR015CYPR015C 744 nt5.5□□□□□ -1.53
BRE1Q07457 YBR126W-AYBR126W-A 207 nt5.5□□□□□ -1.53
BRE1Q07457 ATG14YBR128C 1035 nt5.5□□□□□ -1.53
BRE1Q07457 BLM10YFL007W 6432 nt5.5□□□□□ -1.53
BRE1Q07457 SAY1YGR263C 1275 nt5.49□□□□□ -1.53
BRE1Q07457 ATP12YJL180C 978 nt5.49□□□□□ -1.53
BRE1Q07457 ORM2YLR350W 651 nt5.49□□□□□ -1.53
BRE1Q07457 YBR219CYBR219C 384 nt5.49□□□□□ -1.53
BRE1Q07457 SKG3YLR187W 3081 nt5.49□□□□□ -1.53
BRE1Q07457 ADE6YGR061C 4077 nt5.49□□□□□ -1.53
BRE1Q07457 AVT1YJR001W 1809 nt5.48□□□□□ -1.53
BRE1Q07457 SIR1YKR101W 1965 nt5.48□□□□□ -1.53
BRE1Q07457 RMD5YDR255C 1266 nt5.48□□□□□ -1.53
BRE1Q07457 LPP1YDR503C 825 nt5.48□□□□□ -1.53
BRE1Q07457 SCL1YGL011C 759 nt5.48□□□□□ -1.53
BRE1Q07457 TIM21YGR033C 720 nt5.48□□□□□ -1.53
BRE1Q07457 SPO16YHR153C 597 nt5.48□□□□□ -1.53
BRE1Q07457 BUB3YOR026W 1026 nt5.48□□□□□ -1.53
BRE1Q07457 SYP1YCR030C 2613 nt5.48□□□□□ -1.53
BRE1Q07457 TUB3YML124C 1338 nt5.48□□□□□ -1.53
BRE1Q07457 GSY1YFR015C 2127 nt5.47□□□□□ -1.53
BRE1Q07457 YHL012WYHL012W 1482 nt5.47□□□□□ -1.53
BRE1Q07457 YFR035CYFR035C 345 nt5.47□□□□□ -1.53
BRE1Q07457 YHL045WYHL045W 348 nt5.47□□□□□ -1.53
BRE1Q07457 OMA1YKR087C 1038 nt5.47□□□□□ -1.53
BRE1Q07457 SAP30YMR263W 606 nt5.47□□□□□ -1.53
BRE1Q07457 PUT2YHR037W 1728 nt5.47□□□□□ -1.53
BRE1Q07457 RTC5YOR118W 1704 nt5.47□□□□□ -1.53
BRE1Q07457 TGL1YKL140W 1647 nt5.47□□□□□ -1.53
BRE1Q07457 SIF2YBR103W 1608 nt5.47□□□□□ -1.53
BRE1Q07457 GLN4YOR168W 2430 nt5.47□□□□□ -1.53
BRE1Q07457 YJL206CYJL206C 2277 nt5.46□□□□□ -1.53
BRE1Q07457 SSB2YNL209W 1842 nt5.46□□□□□ -1.53
BRE1Q07457 YDL241WYDL241W 372 nt5.46□□□□□ -1.54
BRE1Q07457 YIL171W-AYIL171W-A 453 nt5.46□□□□□ -1.54
BRE1Q07457 YJL220WYJL220W 453 nt5.46□□□□□ -1.54
BRE1Q07457 YKR047WYKR047W 306 nt5.46□□□□□ -1.54
BRE1Q07457 LTO1YNL260C 597 nt5.46□□□□□ -1.54
BRE1Q07457 THI7YLR237W 1797 nt5.46□□□□□ -1.54
BRE1Q07457 KGD1YIL125W 3045 nt5.46□□□□□ -1.54
BRE1Q07457 TFA1YKL028W 1449 nt5.46□□□□□ -1.54
BRE1Q07457 HSP31YDR533C 714 nt5.45□□□□□ -1.54
BRE1Q07457 TYW3YGL050W 822 nt5.45□□□□□ -1.54
BRE1Q07457 SAE3YHR079C-A 276 nt5.45□□□□□ -1.54
BRE1Q07457 NMA1YLR328W 1206 nt5.45□□□□□ -1.54
BRE1Q07457 BLS1YLR408C 369 nt5.45□□□□□ -1.54
BRE1Q07457 TIF34YMR146C 1044 nt5.45□□□□□ -1.54
BRE1Q07457 YIM2YMR151W 438 nt5.45□□□□□ -1.54
BRE1Q07457 DAL81YIR023W 2913 nt5.45□□□□□ -1.54
BRE1Q07457 GIP4YAL031C 2283 nt5.44□□□□□ -1.54
BRE1Q07457 NAT2YGR147C 867 nt5.44□□□□□ -1.54
BRE1Q07457 CIA2YHR122W 696 nt5.44□□□□□ -1.54
BRE1Q07457 YLR412C-AYLR412C-A 207 nt5.44□□□□□ -1.54
BRE1Q07457 MAG2YLR427W 2013 nt5.44□□□□□ -1.54
BRE1Q07457 MDM30YLR368W 1797 nt5.44□□□□□ -1.54
BRE1Q07457 YTA6YPL074W 2265 nt5.44□□□□□ -1.54
BRE1Q07457 PRR2YDL214C 2100 nt5.44□□□□□ -1.54
BRE1Q07457 RCK2YLR248W 1833 nt5.44□□□□□ -1.54
BRE1Q07457 YCR050CYCR050C 309 nt5.43□□□□□ -1.54
BRE1Q07457 ARF2YDL137W 546 nt5.43□□□□□ -1.54
BRE1Q07457 FRA2YGL220W 363 nt5.43□□□□□ -1.54
BRE1Q07457 DCD1YHR144C 939 nt5.43□□□□□ -1.54
BRE1Q07457 YLR326WYLR326W 723 nt5.43□□□□□ -1.54
BRE1Q07457 UMP1YBR173C 447 nt5.43□□□□□ -1.54
BRE1Q07457 CBF5YLR175W 1452 nt5.43□□□□□ -1.54
BRE1Q07457 CUS1YMR240C 1311 nt5.43□□□□□ -1.54
BRE1Q07457 CDC6YJL194W 1542 nt5.43□□□□□ -1.54
BRE1Q07457 RRB1YMR131C 1536 nt5.43□□□□□ -1.54
BRE1Q07457 ENT1YDL161W 1365 nt5.42□□□□□ -1.54
BRE1Q07457 CDC4YFL009W 2340 nt5.42□□□□□ -1.54
BRE1Q07457 KTR2YKR061W 1278 nt5.42□□□□□ -1.54
BRE1Q07457 YLR225CYLR225C 1224 nt5.42□□□□□ -1.54
BRE1Q07457 YLR374CYLR374C 390 nt5.42□□□□□ -1.54
BRE1Q07457 URE2YNL229C 1065 nt5.42□□□□□ -1.54
BRE1Q07457 SAP4YGL229C 2457 nt5.42□□□□□ -1.54
BRE1Q07457 YDR098C-AYDR098C-A 1323 nt5.42□□□□□ -1.54
BRE1Q07457 YDR210C-CYDR210C-C 1323 nt5.42□□□□□ -1.54
BRE1Q07457 YDR261C-CYDR261C-C 1323 nt5.42□□□□□ -1.54
BRE1Q07457 YDR316W-AYDR316W-A 1323 nt5.42□□□□□ -1.54
BRE1Q07457 YDR365W-AYDR365W-A 1323 nt5.42□□□□□ -1.54
BRE1Q07457 YER137C-AYER137C-A 1323 nt5.42□□□□□ -1.54
BRE1Q07457 YER159C-AYER159C-A 1323 nt5.42□□□□□ -1.54
BRE1Q07457 YGR027W-AYGR027W-A 1323 nt5.42□□□□□ -1.54
BRE1Q07457 YGR038C-AYGR038C-A 1323 nt5.42□□□□□ -1.54
BRE1Q07457 YGR161C-CYGR161C-C 1323 nt5.42□□□□□ -1.54
BRE1Q07457 YJR026WYJR026W 1323 nt5.42□□□□□ -1.54
BRE1Q07457 YJR028WYJR028W 1323 nt5.42□□□□□ -1.54
BRE1Q07457 YAR010CYAR010C 1323 nt5.42□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.6 ms