Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK18Q07002 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK18Q07002 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK18Q07002 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK18Q07002 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK18Q07002 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK18Q07002 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK18Q07002 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK18Q07002 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK18Q07002 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK18Q07002 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK18Q07002 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK18Q07002 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK18Q07002 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK18Q07002 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK18Q07002 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK18Q07002 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK18Q07002 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK18Q07002 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK18Q07002 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK18Q07002 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK18Q07002 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK18Q07002 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK18Q07002 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK18Q07002 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK18Q07002 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK18Q07002 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK18Q07002 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK18Q07002 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK18Q07002 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK18Q07002 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK18Q07002 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK18Q07002 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK18Q07002 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK18Q07002 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK18Q07002 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK18Q07002 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK18Q07002 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK18Q07002 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK18Q07002 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK18Q07002 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK18Q07002 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK18Q07002 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CDK18Q07002 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK18Q07002 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK18Q07002 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK18Q07002 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK18Q07002 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK18Q07002 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK18Q07002 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK18Q07002 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK18Q07002 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK18Q07002 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK18Q07002 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK18Q07002 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK18Q07002 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK18Q07002 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK18Q07002 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK18Q07002 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK18Q07002 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK18Q07002 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK18Q07002 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK18Q07002 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK18Q07002 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK18Q07002 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK18Q07002 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK18Q07002 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK18Q07002 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK18Q07002 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK18Q07002 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK18Q07002 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK18Q07002 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK18Q07002 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK18Q07002 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK18Q07002 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK18Q07002 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK18Q07002 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK18Q07002 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK18Q07002 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK18Q07002 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK18Q07002 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK18Q07002 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK18Q07002 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK18Q07002 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK18Q07002 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK18Q07002 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK18Q07002 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK18Q07002 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK18Q07002 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK18Q07002 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK18Q07002 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK18Q07002 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK18Q07002 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK18Q07002 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK18Q07002 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK18Q07002 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK18Q07002 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK18Q07002 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK18Q07002 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK18Q07002 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms