Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOX4Q06945 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOX4Q06945 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOX4Q06945 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOX4Q06945 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOX4Q06945 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOX4Q06945 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOX4Q06945 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOX4Q06945 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SOX4Q06945 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SOX4Q06945 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SOX4Q06945 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOX4Q06945 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOX4Q06945 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOX4Q06945 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOX4Q06945 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOX4Q06945 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOX4Q06945 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOX4Q06945 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOX4Q06945 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOX4Q06945 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOX4Q06945 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOX4Q06945 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SOX4Q06945 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOX4Q06945 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOX4Q06945 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SOX4Q06945 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOX4Q06945 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOX4Q06945 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOX4Q06945 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOX4Q06945 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOX4Q06945 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOX4Q06945 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOX4Q06945 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOX4Q06945 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOX4Q06945 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOX4Q06945 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOX4Q06945 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOX4Q06945 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOX4Q06945 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOX4Q06945 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SOX4Q06945 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOX4Q06945 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOX4Q06945 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOX4Q06945 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOX4Q06945 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOX4Q06945 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SOX4Q06945 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SOX4Q06945 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SOX4Q06945 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SOX4Q06945 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SOX4Q06945 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SOX4Q06945 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SOX4Q06945 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SOX4Q06945 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SOX4Q06945 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SOX4Q06945 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SOX4Q06945 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SOX4Q06945 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SOX4Q06945 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SOX4Q06945 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SOX4Q06945 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SOX4Q06945 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SOX4Q06945 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SOX4Q06945 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SOX4Q06945 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SOX4Q06945 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SOX4Q06945 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SOX4Q06945 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SOX4Q06945 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SOX4Q06945 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SOX4Q06945 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SOX4Q06945 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SOX4Q06945 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SOX4Q06945 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SOX4Q06945 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SOX4Q06945 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SOX4Q06945 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SOX4Q06945 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SOX4Q06945 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SOX4Q06945 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SOX4Q06945 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SOX4Q06945 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SOX4Q06945 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SOX4Q06945 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SOX4Q06945 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SOX4Q06945 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SOX4Q06945 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SOX4Q06945 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SOX4Q06945 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SOX4Q06945 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SOX4Q06945 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SOX4Q06945 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SOX4Q06945 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SOX4Q06945 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SOX4Q06945 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SOX4Q06945 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SOX4Q06945 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SOX4Q06945 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SOX4Q06945 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms