Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RUNX1T1Q06455 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RUNX1T1Q06455 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RUNX1T1Q06455 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RUNX1T1Q06455 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RUNX1T1Q06455 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RUNX1T1Q06455 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RUNX1T1Q06455 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RUNX1T1Q06455 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RUNX1T1Q06455 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RUNX1T1Q06455 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RUNX1T1Q06455 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RUNX1T1Q06455 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RUNX1T1Q06455 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RUNX1T1Q06455 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RUNX1T1Q06455 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
RUNX1T1Q06455 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RUNX1T1Q06455 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RUNX1T1Q06455 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RUNX1T1Q06455 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RUNX1T1Q06455 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RUNX1T1Q06455 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RUNX1T1Q06455 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RUNX1T1Q06455 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RUNX1T1Q06455 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RUNX1T1Q06455 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RUNX1T1Q06455 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RUNX1T1Q06455 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RUNX1T1Q06455 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNX1T1Q06455 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNX1T1Q06455 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNX1T1Q06455 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNX1T1Q06455 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNX1T1Q06455 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNX1T1Q06455 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNX1T1Q06455 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNX1T1Q06455 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNX1T1Q06455 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNX1T1Q06455 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNX1T1Q06455 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNX1T1Q06455 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNX1T1Q06455 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNX1T1Q06455 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNX1T1Q06455 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNX1T1Q06455 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNX1T1Q06455 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNX1T1Q06455 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNX1T1Q06455 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNX1T1Q06455 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNX1T1Q06455 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNX1T1Q06455 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNX1T1Q06455 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNX1T1Q06455 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNX1T1Q06455 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNX1T1Q06455 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNX1T1Q06455 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNX1T1Q06455 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNX1T1Q06455 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNX1T1Q06455 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNX1T1Q06455 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNX1T1Q06455 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNX1T1Q06455 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNX1T1Q06455 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNX1T1Q06455 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNX1T1Q06455 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNX1T1Q06455 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNX1T1Q06455 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNX1T1Q06455 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNX1T1Q06455 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNX1T1Q06455 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNX1T1Q06455 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNX1T1Q06455 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNX1T1Q06455 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNX1T1Q06455 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNX1T1Q06455 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNX1T1Q06455 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNX1T1Q06455 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUNX1T1Q06455 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUNX1T1Q06455 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUNX1T1Q06455 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUNX1T1Q06455 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUNX1T1Q06455 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RUNX1T1Q06455 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RUNX1T1Q06455 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUNX1T1Q06455 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUNX1T1Q06455 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RUNX1T1Q06455 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUNX1T1Q06455 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUNX1T1Q06455 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNX1T1Q06455 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNX1T1Q06455 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNX1T1Q06455 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNX1T1Q06455 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNX1T1Q06455 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNX1T1Q06455 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNX1T1Q06455 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNX1T1Q06455 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNX1T1Q06455 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNX1T1Q06455 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNX1T1Q06455 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms