Protein–RNA interactions for Protein: Q05016

YMR226C, NADP-dependent 3-hydroxy acid dehydrogenase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR226CQ05016 SRB5YGR104C 924 nt4.16□□□□□ -1.74
YMR226CQ05016 YIL171WYIL171W 330 nt4.16□□□□□ -1.74
YMR226CQ05016 TYW1YPL207W 2433 nt4.16□□□□□ -1.74
YMR226CQ05016 RPO31YOR116C 4383 nt4.16□□□□□ -1.74
YMR226CQ05016 OPT2YPR194C 2634 nt4.16□□□□□ -1.74
YMR226CQ05016 PUT2YHR037W 1728 nt4.15□□□□□ -1.74
YMR226CQ05016 SSA2YLL024C 1920 nt4.15□□□□□ -1.74
YMR226CQ05016 VID30YGL227W 2877 nt4.15□□□□□ -1.74
YMR226CQ05016 RAD27YKL113C 1149 nt4.15□□□□□ -1.75
YMR226CQ05016 NMA1YLR328W 1206 nt4.15□□□□□ -1.75
YMR226CQ05016 MRPL39YML009C 213 nt4.15□□□□□ -1.75
YMR226CQ05016 YMR315WYMR315W 1050 nt4.15□□□□□ -1.75
YMR226CQ05016 SRB6YBR253W 366 nt4.15□□□□□ -1.75
YMR226CQ05016 BRE4YDL231C 3378 nt4.14□□□□□ -1.75
YMR226CQ05016 VHS3YOR054C 2025 nt4.14□□□□□ -1.75
YMR226CQ05016 SSH1YBR283C 1473 nt4.14□□□□□ -1.75
YMR226CQ05016 COS4YFL062W 1140 nt4.14□□□□□ -1.75
YMR226CQ05016 RPL24AYGL031C 468 nt4.14□□□□□ -1.75
YMR226CQ05016 YGR011WYGR011W 327 nt4.14□□□□□ -1.75
YMR226CQ05016 YIL165CYIL165C 360 nt4.14□□□□□ -1.75
YMR226CQ05016 ERG3YLR056W 1098 nt4.14□□□□□ -1.75
YMR226CQ05016 COS3YML132W 1140 nt4.14□□□□□ -1.75
YMR226CQ05016 NOC2YOR206W 2133 nt4.14□□□□□ -1.75
YMR226CQ05016 COS2YBR302C 1140 nt4.14□□□□□ -1.75
YMR226CQ05016 GPI18YBR004C 1302 nt4.14□□□□□ -1.75
YMR226CQ05016 SAT4YCR008W 1812 nt4.14□□□□□ -1.75
YMR226CQ05016 VID28YIL017C 2766 nt4.14□□□□□ -1.75
YMR226CQ05016 RRN11YML043C 1524 nt4.13□□□□□ -1.75
YMR226CQ05016 VPS29YHR012W 849 nt4.13□□□□□ -1.75
YMR226CQ05016 WSS1YHR134W 810 nt4.13□□□□□ -1.75
YMR226CQ05016 YIL163CYIL163C 354 nt4.13□□□□□ -1.75
YMR226CQ05016 MHO1YJR008W 1017 nt4.13□□□□□ -1.75
YMR226CQ05016 RRT7YLL030C 342 nt4.13□□□□□ -1.75
YMR226CQ05016 SPS19YNL202W 879 nt4.13□□□□□ -1.75
YMR226CQ05016 YOR034C-AYOR034C-A 243 nt4.13□□□□□ -1.75
YMR226CQ05016 ATG2YNL242W 4779 nt4.13□□□□□ -1.75
YMR226CQ05016 NOP8YOL144W 1455 nt4.12□□□□□ -1.75
YMR226CQ05016 YDR445CYDR445C 408 nt4.12□□□□□ -1.75
YMR226CQ05016 YER145C-AYER145C-A 438 nt4.12□□□□□ -1.75
YMR226CQ05016 YLR036CYLR036C 612 nt4.12□□□□□ -1.75
YMR226CQ05016 PWR1PWR1 941 nt4.12□□□□□ -1.75
YMR226CQ05016 TPA1YER049W 1935 nt4.12□□□□□ -1.75
YMR226CQ05016 MNN1YER001W 2289 nt4.12□□□□□ -1.75
YMR226CQ05016 MCM2YBL023C 2607 nt4.12□□□□□ -1.75
YMR226CQ05016 YML020WYML020W 1995 nt4.11□□□□□ -1.75
YMR226CQ05016 MAG2YLR427W 2013 nt4.11□□□□□ -1.75
YMR226CQ05016 EKI1YDR147W 1605 nt4.11□□□□□ -1.75
YMR226CQ05016 YDL027CYDL027C 1263 nt4.11□□□□□ -1.75
YMR226CQ05016 HSP42YDR171W 1128 nt4.11□□□□□ -1.75
YMR226CQ05016 SNM1YDR478W 597 nt4.11□□□□□ -1.75
YMR226CQ05016 tQ(UUG)CtQ(UUG)C 72 nt4.11□□□□□ -1.75
YMR226CQ05016 tQ(UUG)D1tQ(UUG)D1 72 nt4.11□□□□□ -1.75
YMR226CQ05016 tQ(UUG)D2tQ(UUG)D2 72 nt4.11□□□□□ -1.75
YMR226CQ05016 tQ(UUG)D3tQ(UUG)D3 72 nt4.11□□□□□ -1.75
YMR226CQ05016 tQ(UUG)E1tQ(UUG)E1 72 nt4.11□□□□□ -1.75
YMR226CQ05016 tQ(UUG)HtQ(UUG)H 72 nt4.11□□□□□ -1.75
YMR226CQ05016 tQ(UUG)LtQ(UUG)L 72 nt4.11□□□□□ -1.75
YMR226CQ05016 OAR1YKL055C 837 nt4.11□□□□□ -1.75
YMR226CQ05016 YLR283WYLR283W 945 nt4.11□□□□□ -1.75
YMR226CQ05016 SSB1YDL229W 1842 nt4.11□□□□□ -1.75
YMR226CQ05016 LPL1YOR059C 1353 nt4.11□□□□□ -1.75
YMR226CQ05016 YIL001WYIL001W 1542 nt4.11□□□□□ -1.75
YMR226CQ05016 LAS1YKR063C 1509 nt4.11□□□□□ -1.75
YMR226CQ05016 RPP1AYDL081C 321 nt4.1□□□□□ -1.75
YMR226CQ05016 RAM1YDL090C 1296 nt4.1□□□□□ -1.75
YMR226CQ05016 IRC7YFR055W 1023 nt4.1□□□□□ -1.75
YMR226CQ05016 YIF1YNL263C 945 nt4.1□□□□□ -1.75
YMR226CQ05016 MDM12YOL009C 816 nt4.1□□□□□ -1.75
YMR226CQ05016 YCF1YDR135C 4548 nt4.1□□□□□ -1.75
YMR226CQ05016 MMR1YLR190W 1476 nt4.1□□□□□ -1.75
YMR226CQ05016 GIP4YAL031C 2283 nt4.1□□□□□ -1.75
YMR226CQ05016 GAL11YOL051W 3246 nt4.1□□□□□ -1.75
YMR226CQ05016 RPS0BYLR048W 759 nt4.09□□□□□ -1.75
YMR226CQ05016 SHE1YBL031W 1017 nt4.09□□□□□ -1.75
YMR226CQ05016 ARG8YOL140W 1272 nt4.09□□□□□ -1.75
YMR226CQ05016 YBR219CYBR219C 384 nt4.09□□□□□ -1.75
YMR226CQ05016 YCL022CYCL022C 516 nt4.09□□□□□ -1.75
YMR226CQ05016 ECM22YLR228C 2445 nt4.09□□□□□ -1.76
YMR226CQ05016 VMA1YDL185W 3216 nt4.08□□□□□ -1.76
YMR226CQ05016 ERG4YGL012W 1422 nt4.08□□□□□ -1.76
YMR226CQ05016 COX4YGL187C 468 nt4.08□□□□□ -1.76
YMR226CQ05016 RPL8AYHL033C 771 nt4.08□□□□□ -1.76
YMR226CQ05016 YHR214WYHR214W 612 nt4.08□□□□□ -1.76
YMR226CQ05016 NSE1YLR007W 1011 nt4.08□□□□□ -1.76
YMR226CQ05016 YAR066WYAR066W 612 nt4.08□□□□□ -1.76
YMR226CQ05016 POL12YBL035C 2118 nt4.08□□□□□ -1.76
YMR226CQ05016 SUI1YNL244C 327 nt4.08□□□□□ -1.76
YMR226CQ05016 POP3YNL282W 588 nt4.08□□□□□ -1.76
YMR226CQ05016 YOL035CYOL035C 303 nt4.08□□□□□ -1.76
YMR226CQ05016 FEX1YOR390W 1128 nt4.08□□□□□ -1.76
YMR226CQ05016 IDI1YPL117C 867 nt4.08□□□□□ -1.76
YMR226CQ05016 FEX2YPL279C 1128 nt4.08□□□□□ -1.76
YMR226CQ05016 JHD2YJR119C 2187 nt4.07□□□□□ -1.76
YMR226CQ05016 DAS2YDR020C 699 nt4.07□□□□□ -1.76
YMR226CQ05016 GRE3YHR104W 984 nt4.07□□□□□ -1.76
YMR226CQ05016 RPL14AYKL006W 417 nt4.07□□□□□ -1.76
YMR226CQ05016 ELO3YLR372W 1038 nt4.07□□□□□ -1.76
YMR226CQ05016 RPS1BYML063W 768 nt4.07□□□□□ -1.76
YMR226CQ05016 SIW14YNL032W 846 nt4.07□□□□□ -1.76
YMR226CQ05016 YNG1YOR064C 660 nt4.07□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.3 ms