Protein–RNA interactions for Protein: Q04695

KRT17, Keratin, type I cytoskeletal 17, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT17Q04695 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT17Q04695 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT17Q04695 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT17Q04695 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT17Q04695 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT17Q04695 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT17Q04695 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT17Q04695 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT17Q04695 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT17Q04695 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT17Q04695 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT17Q04695 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT17Q04695 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT17Q04695 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT17Q04695 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT17Q04695 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT17Q04695 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT17Q04695 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT17Q04695 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT17Q04695 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT17Q04695 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT17Q04695 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT17Q04695 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT17Q04695 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT17Q04695 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT17Q04695 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT17Q04695 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT17Q04695 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT17Q04695 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT17Q04695 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT17Q04695 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT17Q04695 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT17Q04695 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT17Q04695 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT17Q04695 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT17Q04695 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT17Q04695 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT17Q04695 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT17Q04695 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT17Q04695 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT17Q04695 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT17Q04695 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT17Q04695 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT17Q04695 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT17Q04695 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT17Q04695 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT17Q04695 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT17Q04695 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KRT17Q04695 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KRT17Q04695 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KRT17Q04695 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
KRT17Q04695 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KRT17Q04695 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT17Q04695 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT17Q04695 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT17Q04695 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT17Q04695 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT17Q04695 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT17Q04695 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT17Q04695 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT17Q04695 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT17Q04695 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT17Q04695 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT17Q04695 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT17Q04695 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT17Q04695 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT17Q04695 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT17Q04695 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT17Q04695 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT17Q04695 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT17Q04695 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT17Q04695 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT17Q04695 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT17Q04695 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT17Q04695 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT17Q04695 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT17Q04695 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT17Q04695 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT17Q04695 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT17Q04695 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT17Q04695 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT17Q04695 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT17Q04695 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT17Q04695 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT17Q04695 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT17Q04695 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT17Q04695 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT17Q04695 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT17Q04695 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT17Q04695 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT17Q04695 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT17Q04695 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT17Q04695 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT17Q04695 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT17Q04695 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT17Q04695 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT17Q04695 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT17Q04695 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT17Q04695 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT17Q04695 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms