Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GBE1Q04446 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GBE1Q04446 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GBE1Q04446 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GBE1Q04446 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GBE1Q04446 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GBE1Q04446 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GBE1Q04446 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GBE1Q04446 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GBE1Q04446 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GBE1Q04446 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GBE1Q04446 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GBE1Q04446 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GBE1Q04446 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GBE1Q04446 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GBE1Q04446 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GBE1Q04446 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GBE1Q04446 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GBE1Q04446 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GBE1Q04446 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GBE1Q04446 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GBE1Q04446 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GBE1Q04446 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GBE1Q04446 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GBE1Q04446 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GBE1Q04446 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GBE1Q04446 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GBE1Q04446 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GBE1Q04446 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GBE1Q04446 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GBE1Q04446 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GBE1Q04446 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GBE1Q04446 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GBE1Q04446 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GBE1Q04446 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GBE1Q04446 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GBE1Q04446 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GBE1Q04446 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GBE1Q04446 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GBE1Q04446 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GBE1Q04446 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GBE1Q04446 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GBE1Q04446 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GBE1Q04446 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GBE1Q04446 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GBE1Q04446 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GBE1Q04446 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GBE1Q04446 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GBE1Q04446 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GBE1Q04446 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GBE1Q04446 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GBE1Q04446 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GBE1Q04446 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GBE1Q04446 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GBE1Q04446 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GBE1Q04446 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GBE1Q04446 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GBE1Q04446 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GBE1Q04446 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GBE1Q04446 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GBE1Q04446 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GBE1Q04446 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GBE1Q04446 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GBE1Q04446 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GBE1Q04446 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GBE1Q04446 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GBE1Q04446 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GBE1Q04446 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GBE1Q04446 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GBE1Q04446 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GBE1Q04446 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
GBE1Q04446 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GBE1Q04446 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GBE1Q04446 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GBE1Q04446 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GBE1Q04446 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GBE1Q04446 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GBE1Q04446 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GBE1Q04446 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GBE1Q04446 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GBE1Q04446 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GBE1Q04446 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
GBE1Q04446 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GBE1Q04446 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GBE1Q04446 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GBE1Q04446 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GBE1Q04446 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GBE1Q04446 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GBE1Q04446 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GBE1Q04446 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GBE1Q04446 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GBE1Q04446 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GBE1Q04446 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GBE1Q04446 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GBE1Q04446 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GBE1Q04446 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GBE1Q04446 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GBE1Q04446 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GBE1Q04446 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GBE1Q04446 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms