Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SCN7AQ01118 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SCN7AQ01118 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SCN7AQ01118 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SCN7AQ01118 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SCN7AQ01118 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SCN7AQ01118 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SCN7AQ01118 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SCN7AQ01118 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SCN7AQ01118 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
SCN7AQ01118 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SCN7AQ01118 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SCN7AQ01118 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SCN7AQ01118 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SCN7AQ01118 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SCN7AQ01118 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SCN7AQ01118 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SCN7AQ01118 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SCN7AQ01118 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SCN7AQ01118 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SCN7AQ01118 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SCN7AQ01118 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SCN7AQ01118 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SCN7AQ01118 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SCN7AQ01118 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SCN7AQ01118 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SCN7AQ01118 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SCN7AQ01118 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SCN7AQ01118 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SCN7AQ01118 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SCN7AQ01118 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SCN7AQ01118 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SCN7AQ01118 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SCN7AQ01118 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SCN7AQ01118 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SCN7AQ01118 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SCN7AQ01118 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SCN7AQ01118 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SCN7AQ01118 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SCN7AQ01118 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SCN7AQ01118 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SCN7AQ01118 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SCN7AQ01118 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SCN7AQ01118 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SCN7AQ01118 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SCN7AQ01118 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SCN7AQ01118 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SCN7AQ01118 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SCN7AQ01118 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SCN7AQ01118 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SCN7AQ01118 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SCN7AQ01118 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SCN7AQ01118 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SCN7AQ01118 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SCN7AQ01118 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SCN7AQ01118 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SCN7AQ01118 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SCN7AQ01118 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SCN7AQ01118 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SCN7AQ01118 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SCN7AQ01118 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SCN7AQ01118 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SCN7AQ01118 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SCN7AQ01118 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SCN7AQ01118 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SCN7AQ01118 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SCN7AQ01118 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SCN7AQ01118 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SCN7AQ01118 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SCN7AQ01118 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SCN7AQ01118 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SCN7AQ01118 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SCN7AQ01118 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SCN7AQ01118 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SCN7AQ01118 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SCN7AQ01118 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SCN7AQ01118 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SCN7AQ01118 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SCN7AQ01118 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SCN7AQ01118 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SCN7AQ01118 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SCN7AQ01118 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SCN7AQ01118 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SCN7AQ01118 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SCN7AQ01118 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SCN7AQ01118 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SCN7AQ01118 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SCN7AQ01118 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SCN7AQ01118 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SCN7AQ01118 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SCN7AQ01118 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SCN7AQ01118 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SCN7AQ01118 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SCN7AQ01118 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SCN7AQ01118 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SCN7AQ01118 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SCN7AQ01118 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SCN7AQ01118 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SCN7AQ01118 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SCN7AQ01118 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms