Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK16Q00536 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK16Q00536 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK16Q00536 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK16Q00536 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK16Q00536 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK16Q00536 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK16Q00536 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK16Q00536 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK16Q00536 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK16Q00536 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK16Q00536 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK16Q00536 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK16Q00536 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK16Q00536 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK16Q00536 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK16Q00536 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK16Q00536 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK16Q00536 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK16Q00536 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK16Q00536 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK16Q00536 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK16Q00536 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK16Q00536 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK16Q00536 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK16Q00536 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK16Q00536 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK16Q00536 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK16Q00536 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK16Q00536 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK16Q00536 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK16Q00536 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK16Q00536 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK16Q00536 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK16Q00536 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK16Q00536 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK16Q00536 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK16Q00536 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK16Q00536 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK16Q00536 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK16Q00536 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK16Q00536 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK16Q00536 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK16Q00536 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK16Q00536 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK16Q00536 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK16Q00536 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK16Q00536 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK16Q00536 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK16Q00536 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK16Q00536 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK16Q00536 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK16Q00536 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK16Q00536 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK16Q00536 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK16Q00536 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK16Q00536 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK16Q00536 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK16Q00536 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK16Q00536 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK16Q00536 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK16Q00536 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK16Q00536 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK16Q00536 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK16Q00536 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK16Q00536 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK16Q00536 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK16Q00536 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK16Q00536 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK16Q00536 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK16Q00536 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK16Q00536 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK16Q00536 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK16Q00536 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK16Q00536 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK16Q00536 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK16Q00536 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK16Q00536 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK16Q00536 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK16Q00536 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK16Q00536 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK16Q00536 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK16Q00536 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK16Q00536 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK16Q00536 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK16Q00536 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK16Q00536 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK16Q00536 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK16Q00536 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK16Q00536 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK16Q00536 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK16Q00536 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK16Q00536 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK16Q00536 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK16Q00536 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK16Q00536 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK16Q00536 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK16Q00536 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK16Q00536 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK16Q00536 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms