Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HOXC5Q00444 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HOXC5Q00444 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HOXC5Q00444 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HOXC5Q00444 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HOXC5Q00444 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HOXC5Q00444 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HOXC5Q00444 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HOXC5Q00444 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HOXC5Q00444 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HOXC5Q00444 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HOXC5Q00444 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HOXC5Q00444 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HOXC5Q00444 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HOXC5Q00444 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HOXC5Q00444 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HOXC5Q00444 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HOXC5Q00444 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HOXC5Q00444 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HOXC5Q00444 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HOXC5Q00444 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HOXC5Q00444 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HOXC5Q00444 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HOXC5Q00444 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HOXC5Q00444 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HOXC5Q00444 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HOXC5Q00444 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HOXC5Q00444 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HOXC5Q00444 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HOXC5Q00444 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HOXC5Q00444 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HOXC5Q00444 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HOXC5Q00444 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HOXC5Q00444 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HOXC5Q00444 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HOXC5Q00444 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HOXC5Q00444 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HOXC5Q00444 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HOXC5Q00444 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HOXC5Q00444 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HOXC5Q00444 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HOXC5Q00444 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
HOXC5Q00444 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HOXC5Q00444 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HOXC5Q00444 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HOXC5Q00444 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HOXC5Q00444 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HOXC5Q00444 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HOXC5Q00444 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
HOXC5Q00444 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
HOXC5Q00444 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
HOXC5Q00444 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXC5Q00444 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXC5Q00444 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXC5Q00444 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXC5Q00444 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXC5Q00444 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXC5Q00444 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXC5Q00444 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXC5Q00444 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXC5Q00444 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXC5Q00444 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXC5Q00444 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXC5Q00444 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXC5Q00444 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXC5Q00444 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXC5Q00444 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXC5Q00444 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXC5Q00444 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXC5Q00444 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXC5Q00444 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXC5Q00444 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXC5Q00444 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXC5Q00444 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXC5Q00444 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXC5Q00444 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXC5Q00444 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXC5Q00444 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXC5Q00444 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXC5Q00444 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXC5Q00444 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXC5Q00444 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXC5Q00444 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXC5Q00444 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXC5Q00444 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXC5Q00444 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXC5Q00444 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXC5Q00444 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXC5Q00444 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXC5Q00444 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXC5Q00444 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXC5Q00444 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXC5Q00444 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXC5Q00444 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXC5Q00444 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXC5Q00444 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXC5Q00444 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXC5Q00444 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXC5Q00444 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXC5Q00444 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms