Protein–RNA interactions for Protein: P69849

NOMO3, Nodal modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3P69849 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NOMO3P69849 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NOMO3P69849 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NOMO3P69849 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NOMO3P69849 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NOMO3P69849 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NOMO3P69849 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NOMO3P69849 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NOMO3P69849 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NOMO3P69849 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NOMO3P69849 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NOMO3P69849 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NOMO3P69849 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NOMO3P69849 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NOMO3P69849 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NOMO3P69849 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NOMO3P69849 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NOMO3P69849 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NOMO3P69849 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NOMO3P69849 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NOMO3P69849 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NOMO3P69849 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NOMO3P69849 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NOMO3P69849 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NOMO3P69849 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NOMO3P69849 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NOMO3P69849 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NOMO3P69849 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NOMO3P69849 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NOMO3P69849 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NOMO3P69849 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NOMO3P69849 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NOMO3P69849 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NOMO3P69849 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NOMO3P69849 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NOMO3P69849 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NOMO3P69849 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NOMO3P69849 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NOMO3P69849 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NOMO3P69849 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NOMO3P69849 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NOMO3P69849 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NOMO3P69849 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NOMO3P69849 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NOMO3P69849 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NOMO3P69849 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NOMO3P69849 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NOMO3P69849 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NOMO3P69849 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NOMO3P69849 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NOMO3P69849 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NOMO3P69849 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NOMO3P69849 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NOMO3P69849 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NOMO3P69849 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NOMO3P69849 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NOMO3P69849 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NOMO3P69849 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NOMO3P69849 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NOMO3P69849 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NOMO3P69849 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NOMO3P69849 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NOMO3P69849 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NOMO3P69849 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NOMO3P69849 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NOMO3P69849 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NOMO3P69849 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NOMO3P69849 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NOMO3P69849 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NOMO3P69849 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NOMO3P69849 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NOMO3P69849 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NOMO3P69849 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NOMO3P69849 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NOMO3P69849 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NOMO3P69849 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NOMO3P69849 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NOMO3P69849 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NOMO3P69849 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NOMO3P69849 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NOMO3P69849 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NOMO3P69849 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NOMO3P69849 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NOMO3P69849 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NOMO3P69849 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NOMO3P69849 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NOMO3P69849 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NOMO3P69849 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NOMO3P69849 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NOMO3P69849 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NOMO3P69849 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NOMO3P69849 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NOMO3P69849 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NOMO3P69849 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NOMO3P69849 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NOMO3P69849 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NOMO3P69849 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NOMO3P69849 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NOMO3P69849 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NOMO3P69849 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms