Protein–RNA interactions for Protein: P63316

TNNC1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNC1P63316 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNC1P63316 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNC1P63316 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNC1P63316 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNC1P63316 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNC1P63316 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNC1P63316 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNC1P63316 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNC1P63316 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNC1P63316 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNC1P63316 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNC1P63316 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNC1P63316 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNC1P63316 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNC1P63316 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNC1P63316 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNC1P63316 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNC1P63316 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNC1P63316 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNC1P63316 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNC1P63316 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNC1P63316 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNC1P63316 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNC1P63316 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNC1P63316 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNC1P63316 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNC1P63316 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNC1P63316 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNC1P63316 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNC1P63316 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNC1P63316 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNC1P63316 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNC1P63316 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNC1P63316 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNC1P63316 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNC1P63316 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNC1P63316 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNC1P63316 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNC1P63316 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNC1P63316 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNC1P63316 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNC1P63316 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNC1P63316 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNC1P63316 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNC1P63316 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNC1P63316 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNC1P63316 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNC1P63316 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNC1P63316 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNC1P63316 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNC1P63316 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNC1P63316 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNC1P63316 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNC1P63316 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNC1P63316 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNC1P63316 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNC1P63316 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNC1P63316 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNC1P63316 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNC1P63316 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNC1P63316 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNC1P63316 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNC1P63316 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNC1P63316 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNC1P63316 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNC1P63316 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNC1P63316 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNC1P63316 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNC1P63316 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNC1P63316 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNC1P63316 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNC1P63316 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNC1P63316 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNC1P63316 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNC1P63316 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNC1P63316 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNC1P63316 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNC1P63316 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNC1P63316 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNC1P63316 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNC1P63316 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNC1P63316 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNC1P63316 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNC1P63316 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNC1P63316 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNC1P63316 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNC1P63316 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNC1P63316 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNC1P63316 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNC1P63316 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNC1P63316 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNC1P63316 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNC1P63316 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNC1P63316 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNC1P63316 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNC1P63316 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNC1P63316 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNC1P63316 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNC1P63316 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNC1P63316 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms