Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP46P62068 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP46P62068 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP46P62068 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP46P62068 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP46P62068 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP46P62068 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
USP46P62068 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
USP46P62068 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP46P62068 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
USP46P62068 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
USP46P62068 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
USP46P62068 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
USP46P62068 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP46P62068 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP46P62068 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP46P62068 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP46P62068 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP46P62068 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP46P62068 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP46P62068 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP46P62068 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP46P62068 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP46P62068 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP46P62068 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP46P62068 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
USP46P62068 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP46P62068 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP46P62068 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP46P62068 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP46P62068 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP46P62068 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP46P62068 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP46P62068 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP46P62068 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP46P62068 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP46P62068 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP46P62068 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP46P62068 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP46P62068 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP46P62068 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP46P62068 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP46P62068 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP46P62068 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP46P62068 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP46P62068 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP46P62068 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP46P62068 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP46P62068 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP46P62068 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP46P62068 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP46P62068 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP46P62068 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP46P62068 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP46P62068 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP46P62068 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP46P62068 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP46P62068 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP46P62068 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP46P62068 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP46P62068 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP46P62068 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP46P62068 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP46P62068 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP46P62068 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP46P62068 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP46P62068 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP46P62068 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP46P62068 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP46P62068 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP46P62068 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP46P62068 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP46P62068 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP46P62068 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP46P62068 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP46P62068 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP46P62068 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP46P62068 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP46P62068 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP46P62068 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP46P62068 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP46P62068 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
USP46P62068 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP46P62068 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP46P62068 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP46P62068 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP46P62068 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP46P62068 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP46P62068 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP46P62068 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP46P62068 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP46P62068 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP46P62068 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
USP46P62068 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP46P62068 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP46P62068 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP46P62068 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP46P62068 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP46P62068 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP46P62068 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms