Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM258P61165 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM258P61165 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM258P61165 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM258P61165 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM258P61165 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM258P61165 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM258P61165 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM258P61165 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM258P61165 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM258P61165 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM258P61165 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM258P61165 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM258P61165 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM258P61165 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM258P61165 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM258P61165 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM258P61165 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM258P61165 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM258P61165 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM258P61165 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM258P61165 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM258P61165 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM258P61165 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM258P61165 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM258P61165 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMEM258P61165 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMEM258P61165 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMEM258P61165 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMEM258P61165 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMEM258P61165 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMEM258P61165 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMEM258P61165 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TMEM258P61165 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMEM258P61165 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMEM258P61165 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMEM258P61165 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMEM258P61165 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMEM258P61165 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMEM258P61165 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMEM258P61165 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMEM258P61165 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMEM258P61165 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMEM258P61165 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMEM258P61165 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMEM258P61165 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMEM258P61165 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMEM258P61165 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMEM258P61165 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMEM258P61165 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMEM258P61165 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMEM258P61165 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMEM258P61165 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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TMEM258P61165 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMEM258P61165 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMEM258P61165 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMEM258P61165 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMEM258P61165 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMEM258P61165 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMEM258P61165 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMEM258P61165 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
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TMEM258P61165 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMEM258P61165 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMEM258P61165 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TMEM258P61165 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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TMEM258P61165 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM258P61165 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM258P61165 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM258P61165 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM258P61165 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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TMEM258P61165 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM258P61165 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM258P61165 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM258P61165 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM258P61165 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM258P61165 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM258P61165 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM258P61165 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM258P61165 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM258P61165 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM258P61165 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM258P61165 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM258P61165 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM258P61165 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM258P61165 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM258P61165 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM258P61165 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM258P61165 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM258P61165 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM258P61165 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM258P61165 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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