Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CABP4P57796 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CABP4P57796 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CABP4P57796 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CABP4P57796 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CABP4P57796 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CABP4P57796 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CABP4P57796 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CABP4P57796 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CABP4P57796 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CABP4P57796 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
CABP4P57796 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CABP4P57796 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CABP4P57796 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CABP4P57796 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CABP4P57796 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CABP4P57796 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CABP4P57796 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CABP4P57796 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CABP4P57796 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CABP4P57796 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CABP4P57796 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CABP4P57796 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CABP4P57796 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CABP4P57796 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CABP4P57796 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CABP4P57796 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CABP4P57796 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CABP4P57796 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CABP4P57796 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CABP4P57796 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CABP4P57796 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CABP4P57796 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CABP4P57796 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CABP4P57796 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CABP4P57796 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CABP4P57796 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CABP4P57796 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CABP4P57796 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CABP4P57796 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CABP4P57796 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CABP4P57796 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CABP4P57796 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CABP4P57796 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CABP4P57796 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CABP4P57796 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CABP4P57796 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CABP4P57796 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CABP4P57796 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CABP4P57796 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CABP4P57796 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CABP4P57796 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CABP4P57796 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CABP4P57796 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CABP4P57796 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CABP4P57796 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CABP4P57796 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CABP4P57796 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CABP4P57796 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CABP4P57796 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
CABP4P57796 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CABP4P57796 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
CABP4P57796 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CABP4P57796 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CABP4P57796 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CABP4P57796 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CABP4P57796 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CABP4P57796 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CABP4P57796 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CABP4P57796 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CABP4P57796 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CABP4P57796 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CABP4P57796 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CABP4P57796 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CABP4P57796 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CABP4P57796 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CABP4P57796 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CABP4P57796 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CABP4P57796 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CABP4P57796 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CABP4P57796 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CABP4P57796 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CABP4P57796 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CABP4P57796 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CABP4P57796 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CABP4P57796 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CABP4P57796 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CABP4P57796 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CABP4P57796 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CABP4P57796 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CABP4P57796 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CABP4P57796 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CABP4P57796 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CABP4P57796 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CABP4P57796 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CABP4P57796 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CABP4P57796 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CABP4P57796 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CABP4P57796 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CABP4P57796 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms