Protein–RNA interactions for Protein: P57764

GSDMD, Gasdermin-D, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMDP57764 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GSDMDP57764 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GSDMDP57764 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GSDMDP57764 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GSDMDP57764 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GSDMDP57764 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GSDMDP57764 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GSDMDP57764 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GSDMDP57764 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GSDMDP57764 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GSDMDP57764 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GSDMDP57764 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GSDMDP57764 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GSDMDP57764 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GSDMDP57764 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GSDMDP57764 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GSDMDP57764 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GSDMDP57764 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GSDMDP57764 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GSDMDP57764 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GSDMDP57764 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GSDMDP57764 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GSDMDP57764 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GSDMDP57764 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GSDMDP57764 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GSDMDP57764 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GSDMDP57764 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GSDMDP57764 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GSDMDP57764 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GSDMDP57764 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GSDMDP57764 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GSDMDP57764 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GSDMDP57764 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GSDMDP57764 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GSDMDP57764 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GSDMDP57764 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GSDMDP57764 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GSDMDP57764 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GSDMDP57764 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GSDMDP57764 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GSDMDP57764 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GSDMDP57764 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GSDMDP57764 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GSDMDP57764 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GSDMDP57764 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GSDMDP57764 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GSDMDP57764 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GSDMDP57764 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GSDMDP57764 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GSDMDP57764 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GSDMDP57764 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GSDMDP57764 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GSDMDP57764 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GSDMDP57764 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GSDMDP57764 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GSDMDP57764 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GSDMDP57764 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GSDMDP57764 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GSDMDP57764 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GSDMDP57764 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GSDMDP57764 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GSDMDP57764 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GSDMDP57764 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GSDMDP57764 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GSDMDP57764 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GSDMDP57764 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GSDMDP57764 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GSDMDP57764 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GSDMDP57764 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GSDMDP57764 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GSDMDP57764 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GSDMDP57764 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GSDMDP57764 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GSDMDP57764 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GSDMDP57764 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GSDMDP57764 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GSDMDP57764 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GSDMDP57764 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GSDMDP57764 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GSDMDP57764 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GSDMDP57764 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GSDMDP57764 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GSDMDP57764 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GSDMDP57764 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GSDMDP57764 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GSDMDP57764 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GSDMDP57764 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GSDMDP57764 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GSDMDP57764 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GSDMDP57764 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GSDMDP57764 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GSDMDP57764 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GSDMDP57764 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GSDMDP57764 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GSDMDP57764 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GSDMDP57764 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GSDMDP57764 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GSDMDP57764 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GSDMDP57764 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GSDMDP57764 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms