Protein–RNA interactions for Protein: P56693

SOX10, Transcription factor SOX-10, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX10P56693 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SOX10P56693 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SOX10P56693 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SOX10P56693 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SOX10P56693 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SOX10P56693 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SOX10P56693 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SOX10P56693 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SOX10P56693 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SOX10P56693 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SOX10P56693 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SOX10P56693 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SOX10P56693 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SOX10P56693 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SOX10P56693 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SOX10P56693 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SOX10P56693 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SOX10P56693 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SOX10P56693 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SOX10P56693 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SOX10P56693 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SOX10P56693 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SOX10P56693 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SOX10P56693 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SOX10P56693 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SOX10P56693 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SOX10P56693 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SOX10P56693 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SOX10P56693 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SOX10P56693 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SOX10P56693 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SOX10P56693 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SOX10P56693 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SOX10P56693 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SOX10P56693 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SOX10P56693 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SOX10P56693 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SOX10P56693 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SOX10P56693 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SOX10P56693 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SOX10P56693 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SOX10P56693 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SOX10P56693 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SOX10P56693 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SOX10P56693 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SOX10P56693 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SOX10P56693 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SOX10P56693 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SOX10P56693 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SOX10P56693 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SOX10P56693 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SOX10P56693 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SOX10P56693 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SOX10P56693 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SOX10P56693 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SOX10P56693 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SOX10P56693 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SOX10P56693 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SOX10P56693 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SOX10P56693 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SOX10P56693 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SOX10P56693 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SOX10P56693 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SOX10P56693 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SOX10P56693 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SOX10P56693 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SOX10P56693 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SOX10P56693 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SOX10P56693 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SOX10P56693 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SOX10P56693 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SOX10P56693 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SOX10P56693 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SOX10P56693 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SOX10P56693 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SOX10P56693 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SOX10P56693 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SOX10P56693 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SOX10P56693 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SOX10P56693 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SOX10P56693 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SOX10P56693 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SOX10P56693 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SOX10P56693 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SOX10P56693 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SOX10P56693 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SOX10P56693 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SOX10P56693 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SOX10P56693 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SOX10P56693 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SOX10P56693 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SOX10P56693 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SOX10P56693 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SOX10P56693 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SOX10P56693 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SOX10P56693 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SOX10P56693 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SOX10P56693 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SOX10P56693 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SOX10P56693 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms