Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NME5P56597 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NME5P56597 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NME5P56597 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NME5P56597 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NME5P56597 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NME5P56597 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NME5P56597 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NME5P56597 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NME5P56597 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NME5P56597 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NME5P56597 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NME5P56597 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NME5P56597 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NME5P56597 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NME5P56597 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NME5P56597 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NME5P56597 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NME5P56597 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NME5P56597 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NME5P56597 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NME5P56597 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NME5P56597 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NME5P56597 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NME5P56597 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NME5P56597 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NME5P56597 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NME5P56597 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NME5P56597 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NME5P56597 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NME5P56597 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NME5P56597 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NME5P56597 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NME5P56597 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NME5P56597 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NME5P56597 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NME5P56597 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NME5P56597 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NME5P56597 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NME5P56597 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NME5P56597 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NME5P56597 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NME5P56597 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NME5P56597 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NME5P56597 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NME5P56597 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NME5P56597 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NME5P56597 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NME5P56597 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NME5P56597 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NME5P56597 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NME5P56597 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NME5P56597 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NME5P56597 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NME5P56597 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NME5P56597 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NME5P56597 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NME5P56597 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NME5P56597 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NME5P56597 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NME5P56597 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NME5P56597 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NME5P56597 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NME5P56597 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NME5P56597 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NME5P56597 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NME5P56597 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NME5P56597 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NME5P56597 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NME5P56597 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NME5P56597 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NME5P56597 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NME5P56597 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NME5P56597 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NME5P56597 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NME5P56597 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NME5P56597 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NME5P56597 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NME5P56597 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NME5P56597 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NME5P56597 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NME5P56597 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NME5P56597 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NME5P56597 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NME5P56597 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NME5P56597 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NME5P56597 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NME5P56597 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NME5P56597 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NME5P56597 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NME5P56597 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NME5P56597 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NME5P56597 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NME5P56597 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NME5P56597 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NME5P56597 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NME5P56597 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NME5P56597 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NME5P56597 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NME5P56597 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms