Protein–RNA interactions for Protein: P55327

TPD52, Tumor protein D52, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52P55327 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPD52P55327 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPD52P55327 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPD52P55327 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TPD52P55327 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPD52P55327 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPD52P55327 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPD52P55327 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPD52P55327 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPD52P55327 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPD52P55327 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPD52P55327 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPD52P55327 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPD52P55327 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TPD52P55327 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPD52P55327 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TPD52P55327 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPD52P55327 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPD52P55327 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TPD52P55327 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TPD52P55327 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TPD52P55327 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TPD52P55327 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPD52P55327 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TPD52P55327 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPD52P55327 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TPD52P55327 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPD52P55327 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPD52P55327 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPD52P55327 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TPD52P55327 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TPD52P55327 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPD52P55327 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPD52P55327 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPD52P55327 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPD52P55327 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TPD52P55327 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TPD52P55327 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPD52P55327 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TPD52P55327 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPD52P55327 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPD52P55327 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TPD52P55327 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TPD52P55327 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TPD52P55327 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TPD52P55327 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TPD52P55327 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TPD52P55327 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TPD52P55327 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TPD52P55327 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TPD52P55327 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TPD52P55327 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TPD52P55327 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TPD52P55327 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TPD52P55327 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TPD52P55327 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPD52P55327 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPD52P55327 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TPD52P55327 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPD52P55327 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TPD52P55327 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPD52P55327 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPD52P55327 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPD52P55327 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TPD52P55327 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPD52P55327 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TPD52P55327 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPD52P55327 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPD52P55327 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TPD52P55327 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TPD52P55327 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TPD52P55327 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPD52P55327 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TPD52P55327 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPD52P55327 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TPD52P55327 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPD52P55327 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TPD52P55327 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TPD52P55327 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TPD52P55327 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TPD52P55327 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TPD52P55327 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TPD52P55327 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TPD52P55327 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TPD52P55327 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
TPD52P55327 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TPD52P55327 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TPD52P55327 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TPD52P55327 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPD52P55327 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPD52P55327 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPD52P55327 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPD52P55327 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPD52P55327 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPD52P55327 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TPD52P55327 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPD52P55327 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPD52P55327 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPD52P55327 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPD52P55327 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms