Protein–RNA interactions for Protein: P54849

EMP1, Epithelial membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP1P54849 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EMP1P54849 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EMP1P54849 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EMP1P54849 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EMP1P54849 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EMP1P54849 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EMP1P54849 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EMP1P54849 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EMP1P54849 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EMP1P54849 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
EMP1P54849 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EMP1P54849 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EMP1P54849 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
EMP1P54849 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EMP1P54849 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EMP1P54849 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EMP1P54849 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
EMP1P54849 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EMP1P54849 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EMP1P54849 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EMP1P54849 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
EMP1P54849 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EMP1P54849 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EMP1P54849 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EMP1P54849 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EMP1P54849 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EMP1P54849 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EMP1P54849 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EMP1P54849 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EMP1P54849 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EMP1P54849 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EMP1P54849 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EMP1P54849 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EMP1P54849 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EMP1P54849 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EMP1P54849 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EMP1P54849 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EMP1P54849 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EMP1P54849 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EMP1P54849 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EMP1P54849 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EMP1P54849 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EMP1P54849 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EMP1P54849 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EMP1P54849 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
EMP1P54849 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EMP1P54849 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EMP1P54849 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EMP1P54849 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EMP1P54849 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EMP1P54849 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EMP1P54849 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EMP1P54849 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EMP1P54849 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EMP1P54849 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EMP1P54849 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EMP1P54849 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
EMP1P54849 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EMP1P54849 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EMP1P54849 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EMP1P54849 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EMP1P54849 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
EMP1P54849 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EMP1P54849 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EMP1P54849 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EMP1P54849 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EMP1P54849 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EMP1P54849 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EMP1P54849 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EMP1P54849 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EMP1P54849 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EMP1P54849 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
EMP1P54849 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EMP1P54849 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EMP1P54849 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EMP1P54849 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EMP1P54849 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EMP1P54849 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EMP1P54849 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EMP1P54849 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EMP1P54849 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EMP1P54849 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EMP1P54849 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EMP1P54849 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EMP1P54849 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EMP1P54849 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EMP1P54849 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EMP1P54849 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EMP1P54849 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EMP1P54849 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EMP1P54849 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EMP1P54849 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EMP1P54849 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EMP1P54849 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EMP1P54849 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EMP1P54849 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EMP1P54849 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EMP1P54849 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EMP1P54849 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EMP1P54849 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms