Protein–RNA interactions for Protein: P54845

NRL, Neural retina-specific leucine zipper protein, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRLP54845 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NRLP54845 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NRLP54845 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NRLP54845 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NRLP54845 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NRLP54845 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NRLP54845 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NRLP54845 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NRLP54845 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NRLP54845 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NRLP54845 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NRLP54845 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NRLP54845 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NRLP54845 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NRLP54845 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NRLP54845 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NRLP54845 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NRLP54845 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NRLP54845 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NRLP54845 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NRLP54845 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NRLP54845 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NRLP54845 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NRLP54845 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NRLP54845 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NRLP54845 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NRLP54845 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NRLP54845 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NRLP54845 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NRLP54845 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NRLP54845 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NRLP54845 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NRLP54845 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NRLP54845 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NRLP54845 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NRLP54845 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NRLP54845 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NRLP54845 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NRLP54845 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NRLP54845 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NRLP54845 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NRLP54845 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NRLP54845 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NRLP54845 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NRLP54845 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NRLP54845 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NRLP54845 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NRLP54845 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NRLP54845 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NRLP54845 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NRLP54845 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NRLP54845 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NRLP54845 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NRLP54845 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NRLP54845 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NRLP54845 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NRLP54845 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NRLP54845 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NRLP54845 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NRLP54845 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NRLP54845 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NRLP54845 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NRLP54845 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NRLP54845 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NRLP54845 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NRLP54845 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NRLP54845 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NRLP54845 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NRLP54845 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NRLP54845 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NRLP54845 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NRLP54845 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NRLP54845 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NRLP54845 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NRLP54845 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NRLP54845 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NRLP54845 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NRLP54845 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NRLP54845 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NRLP54845 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NRLP54845 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NRLP54845 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NRLP54845 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NRLP54845 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NRLP54845 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NRLP54845 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NRLP54845 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NRLP54845 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NRLP54845 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NRLP54845 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NRLP54845 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NRLP54845 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NRLP54845 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NRLP54845 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NRLP54845 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NRLP54845 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NRLP54845 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NRLP54845 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NRLP54845 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NRLP54845 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms