Protein–RNA interactions for Protein: P54278

PMS2, Mismatch repair endonuclease PMS2, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P54278 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PMS2P54278 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PMS2P54278 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PMS2P54278 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PMS2P54278 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PMS2P54278 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PMS2P54278 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PMS2P54278 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PMS2P54278 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PMS2P54278 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PMS2P54278 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PMS2P54278 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PMS2P54278 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PMS2P54278 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PMS2P54278 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PMS2P54278 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PMS2P54278 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PMS2P54278 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PMS2P54278 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PMS2P54278 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PMS2P54278 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PMS2P54278 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PMS2P54278 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PMS2P54278 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PMS2P54278 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PMS2P54278 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PMS2P54278 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PMS2P54278 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PMS2P54278 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PMS2P54278 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PMS2P54278 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PMS2P54278 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PMS2P54278 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PMS2P54278 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PMS2P54278 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PMS2P54278 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PMS2P54278 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PMS2P54278 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PMS2P54278 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PMS2P54278 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PMS2P54278 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PMS2P54278 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PMS2P54278 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PMS2P54278 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PMS2P54278 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PMS2P54278 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PMS2P54278 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PMS2P54278 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PMS2P54278 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PMS2P54278 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PMS2P54278 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PMS2P54278 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PMS2P54278 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PMS2P54278 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PMS2P54278 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PMS2P54278 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PMS2P54278 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PMS2P54278 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PMS2P54278 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PMS2P54278 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PMS2P54278 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PMS2P54278 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PMS2P54278 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PMS2P54278 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PMS2P54278 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PMS2P54278 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PMS2P54278 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PMS2P54278 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PMS2P54278 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PMS2P54278 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PMS2P54278 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PMS2P54278 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PMS2P54278 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PMS2P54278 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PMS2P54278 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PMS2P54278 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PMS2P54278 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PMS2P54278 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PMS2P54278 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PMS2P54278 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PMS2P54278 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PMS2P54278 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PMS2P54278 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PMS2P54278 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PMS2P54278 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PMS2P54278 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PMS2P54278 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PMS2P54278 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PMS2P54278 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PMS2P54278 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PMS2P54278 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PMS2P54278 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PMS2P54278 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PMS2P54278 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PMS2P54278 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PMS2P54278 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PMS2P54278 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PMS2P54278 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PMS2P54278 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PMS2P54278 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms