Protein–RNA interactions for Protein: P54107

CRISP1, Cysteine-rich secretory protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP1P54107 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRISP1P54107 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRISP1P54107 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRISP1P54107 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRISP1P54107 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRISP1P54107 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRISP1P54107 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRISP1P54107 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRISP1P54107 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRISP1P54107 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRISP1P54107 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRISP1P54107 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRISP1P54107 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRISP1P54107 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRISP1P54107 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRISP1P54107 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRISP1P54107 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRISP1P54107 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRISP1P54107 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRISP1P54107 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRISP1P54107 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRISP1P54107 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRISP1P54107 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRISP1P54107 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRISP1P54107 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRISP1P54107 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRISP1P54107 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRISP1P54107 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRISP1P54107 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRISP1P54107 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRISP1P54107 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRISP1P54107 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRISP1P54107 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRISP1P54107 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRISP1P54107 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRISP1P54107 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRISP1P54107 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRISP1P54107 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRISP1P54107 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRISP1P54107 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRISP1P54107 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRISP1P54107 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRISP1P54107 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CRISP1P54107 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CRISP1P54107 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CRISP1P54107 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CRISP1P54107 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CRISP1P54107 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CRISP1P54107 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CRISP1P54107 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CRISP1P54107 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CRISP1P54107 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CRISP1P54107 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CRISP1P54107 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CRISP1P54107 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CRISP1P54107 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CRISP1P54107 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRISP1P54107 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRISP1P54107 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRISP1P54107 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRISP1P54107 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRISP1P54107 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRISP1P54107 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRISP1P54107 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRISP1P54107 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRISP1P54107 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRISP1P54107 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRISP1P54107 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRISP1P54107 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRISP1P54107 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRISP1P54107 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRISP1P54107 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRISP1P54107 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRISP1P54107 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRISP1P54107 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRISP1P54107 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CRISP1P54107 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRISP1P54107 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRISP1P54107 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CRISP1P54107 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRISP1P54107 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRISP1P54107 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRISP1P54107 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRISP1P54107 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRISP1P54107 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRISP1P54107 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRISP1P54107 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRISP1P54107 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRISP1P54107 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRISP1P54107 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRISP1P54107 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRISP1P54107 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRISP1P54107 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRISP1P54107 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRISP1P54107 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRISP1P54107 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRISP1P54107 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRISP1P54107 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRISP1P54107 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRISP1P54107 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms