Protein–RNA interactions for Protein: P53965

SIW14, Tyrosine-protein phosphatase SIW14, yeastyeast

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SIW14P53965 RRP4YHR069C 1080 nt5.8□□□□□ -1.48
SIW14P53965 AIM18YHR198C 966 nt5.8□□□□□ -1.48
SIW14P53965 VPS25YJR102C 609 nt5.8□□□□□ -1.48
SIW14P53965 YBR053CYBR053C 1077 nt5.8□□□□□ -1.48
SIW14P53965 GRE1YPL223C 507 nt5.8□□□□□ -1.48
SIW14P53965 YML082WYML082W 1950 nt5.8□□□□□ -1.48
SIW14P53965 YTM1YOR272W 1383 nt5.8□□□□□ -1.48
SIW14P53965 HOF1YMR032W 2010 nt5.79□□□□□ -1.48
SIW14P53965 QRI7YDL104C 1224 nt5.79□□□□□ -1.48
SIW14P53965 HSP42YDR171W 1128 nt5.79□□□□□ -1.48
SIW14P53965 DOG2YHR043C 741 nt5.79□□□□□ -1.48
SIW14P53965 DOG1YHR044C 741 nt5.79□□□□□ -1.48
SIW14P53965 APS3YJL024C 585 nt5.79□□□□□ -1.48
SIW14P53965 CPR3YML078W 549 nt5.79□□□□□ -1.48
SIW14P53965 MRPS17YMR188C 714 nt5.79□□□□□ -1.48
SIW14P53965 BUD17YNR027W 954 nt5.79□□□□□ -1.48
SIW14P53965 SME1YOR159C 285 nt5.79□□□□□ -1.48
SIW14P53965 YOR200WYOR200W 399 nt5.79□□□□□ -1.48
SIW14P53965 YBR116CYBR116C 528 nt5.79□□□□□ -1.48
SIW14P53965 RRP7YCL031C 894 nt5.79□□□□□ -1.48
SIW14P53965 YRF1-4YLR466W 4149 nt5.79□□□□□ -1.48
SIW14P53965 KTR6YPL053C 1341 nt5.78□□□□□ -1.48
SIW14P53965 SEC20YDR498C 1152 nt5.78□□□□□ -1.48
SIW14P53965 RPL22BYFL034C-A 369 nt5.78□□□□□ -1.48
SIW14P53965 YIP5YGL161C 933 nt5.78□□□□□ -1.48
SIW14P53965 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt5.78□□□□□ -1.48
SIW14P53965 PFS1YHR185C 714 nt5.78□□□□□ -1.48
SIW14P53965 DUG3YNL191W 1074 nt5.78□□□□□ -1.48
SIW14P53965 MDM38YOL027C 1722 nt5.78□□□□□ -1.48
SIW14P53965 CCL1YPR025C 1182 nt5.78□□□□□ -1.48
SIW14P53965 VPS5YOR069W 2028 nt5.77□□□□□ -1.49
SIW14P53965 RBA50YDR527W 1320 nt5.77□□□□□ -1.49
SIW14P53965 ESC8YOL017W 2145 nt5.77□□□□□ -1.49
SIW14P53965 SAG1YJR004C 1953 nt5.77□□□□□ -1.49
SIW14P53965 PMT5YDL093W 2232 nt5.77□□□□□ -1.49
SIW14P53965 STB5YHR178W 2232 nt5.77□□□□□ -1.49
SIW14P53965 ATO3YDR384C 828 nt5.77□□□□□ -1.49
SIW14P53965 YER085CYER085C 522 nt5.77□□□□□ -1.49
SIW14P53965 TYS1YGR185C 1185 nt5.77□□□□□ -1.49
SIW14P53965 SRT1YMR101C 1032 nt5.77□□□□□ -1.49
SIW14P53965 SNO4YMR322C 714 nt5.77□□□□□ -1.49
SIW14P53965 TYE7YOR344C 876 nt5.77□□□□□ -1.49
SIW14P53965 HSP33YOR391C 714 nt5.77□□□□□ -1.49
SIW14P53965 HSP32YPL280W 714 nt5.77□□□□□ -1.49
SIW14P53965 YPR177CYPR177C 372 nt5.77□□□□□ -1.49
SIW14P53965 YBR196C-BYBR196C-B 105 nt5.77□□□□□ -1.49
SIW14P53965 YBR287WYBR287W 1284 nt5.77□□□□□ -1.49
SIW14P53965 VBA1YMR088C 1689 nt5.77□□□□□ -1.49
SIW14P53965 AAP1YHR047C 2571 nt5.77□□□□□ -1.49
SIW14P53965 SSK1YLR006C 2139 nt5.77□□□□□ -1.49
SIW14P53965 SIS2YKR072C 1689 nt5.76□□□□□ -1.49
SIW14P53965 MDH3YDL078C 1032 nt5.76□□□□□ -1.49
SIW14P53965 AIR2YDL175C 1035 nt5.76□□□□□ -1.49
SIW14P53965 ERJ5YFR041C 888 nt5.76□□□□□ -1.49
SIW14P53965 EGD2YHR193C 525 nt5.76□□□□□ -1.49
SIW14P53965 YNL320WYNL320W 855 nt5.76□□□□□ -1.49
SIW14P53965 CYC2YOR037W 1101 nt5.76□□□□□ -1.49
SIW14P53965 YBR255C-AYBR255C-A 363 nt5.76□□□□□ -1.49
SIW14P53965 YFL040WYFL040W 1623 nt5.76□□□□□ -1.49
SIW14P53965 YME1YPR024W 2244 nt5.76□□□□□ -1.49
SIW14P53965 PYC1YGL062W 3537 nt5.76□□□□□ -1.49
SIW14P53965 YEH1YLL012W 1722 nt5.76□□□□□ -1.49
SIW14P53965 YMD8YML038C 1329 nt5.75□□□□□ -1.49
SIW14P53965 MPP10YJR002W 1782 nt5.75□□□□□ -1.49
SIW14P53965 DPH2YKL191W 1605 nt5.75□□□□□ -1.49
SIW14P53965 YCL065WYCL065W 369 nt5.75□□□□□ -1.49
SIW14P53965 SPT15YER148W 723 nt5.75□□□□□ -1.49
SIW14P53965 YFH7YFR007W 1062 nt5.75□□□□□ -1.49
SIW14P53965 RPL7AYGL076C 735 nt5.75□□□□□ -1.49
SIW14P53965 MF(ALPHA)2YGL089C 363 nt5.75□□□□□ -1.49
SIW14P53965 PRP38YGR075C 729 nt5.75□□□□□ -1.49
SIW14P53965 COS8YHL048W 1146 nt5.75□□□□□ -1.49
SIW14P53965 AIM19YIL087C 474 nt5.75□□□□□ -1.49
SIW14P53965 RPL7BYPL198W 735 nt5.75□□□□□ -1.49
SIW14P53965 MLC2YPR188C 492 nt5.75□□□□□ -1.49
SIW14P53965 SHE3YBR130C 1278 nt5.75□□□□□ -1.49
SIW14P53965 YCR047W-AYCR047W-A 207 nt5.74□□□□□ -1.49
SIW14P53965 MHF2YDL160C-A 243 nt5.74□□□□□ -1.49
SIW14P53965 COQ4YDR204W 1008 nt5.74□□□□□ -1.49
SIW14P53965 YRA1YDR381W 681 nt5.74□□□□□ -1.49
SIW14P53965 YGL214WYGL214W 486 nt5.74□□□□□ -1.49
SIW14P53965 SCEIQ0160 708 nt5.74□□□□□ -1.49
SIW14P53965 COX6YHR051W 447 nt5.74□□□□□ -1.49
SIW14P53965 PAN6YIL145C 930 nt5.74□□□□□ -1.49
SIW14P53965 TFS1YLR178C 660 nt5.74□□□□□ -1.49
SIW14P53965 YLR456WYLR456W 615 nt5.74□□□□□ -1.49
SIW14P53965 GPI12YMR281W 915 nt5.74□□□□□ -1.49
SIW14P53965 ADE13YLR359W 1449 nt5.74□□□□□ -1.49
SIW14P53965 SPO1YNL012W 1896 nt5.73□□□□□ -1.49
SIW14P53965 MGA1YGR249W 1371 nt5.73□□□□□ -1.49
SIW14P53965 RPN9YDR427W 1182 nt5.73□□□□□ -1.49
SIW14P53965 HIS6YIL020C 786 nt5.73□□□□□ -1.49
SIW14P53965 EFM4YIL064W 774 nt5.73□□□□□ -1.49
SIW14P53965 YKL177WYKL177W 339 nt5.73□□□□□ -1.49
SIW14P53965 INP1YMR204C 1263 nt5.73□□□□□ -1.49
SIW14P53965 FOB1YDR110W 1701 nt5.73□□□□□ -1.49
SIW14P53965 IMA3YIL172C 1770 nt5.72□□□□□ -1.49
SIW14P53965 IMA4YJL221C 1770 nt5.72□□□□□ -1.49
SIW14P53965 HSP104YLL026W 2727 nt5.72□□□□□ -1.49
SIW14P53965 YDL057WYDL057W 987 nt5.72□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.8 ms