Protein–RNA interactions for Protein: P53611

RABGGTB, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTBP53611 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RABGGTBP53611 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RABGGTBP53611 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RABGGTBP53611 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RABGGTBP53611 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RABGGTBP53611 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RABGGTBP53611 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RABGGTBP53611 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RABGGTBP53611 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RABGGTBP53611 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RABGGTBP53611 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RABGGTBP53611 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RABGGTBP53611 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RABGGTBP53611 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RABGGTBP53611 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RABGGTBP53611 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RABGGTBP53611 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RABGGTBP53611 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RABGGTBP53611 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RABGGTBP53611 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RABGGTBP53611 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RABGGTBP53611 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RABGGTBP53611 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RABGGTBP53611 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RABGGTBP53611 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RABGGTBP53611 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RABGGTBP53611 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RABGGTBP53611 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RABGGTBP53611 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RABGGTBP53611 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RABGGTBP53611 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RABGGTBP53611 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RABGGTBP53611 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RABGGTBP53611 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RABGGTBP53611 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RABGGTBP53611 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RABGGTBP53611 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RABGGTBP53611 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RABGGTBP53611 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RABGGTBP53611 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RABGGTBP53611 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RABGGTBP53611 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RABGGTBP53611 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RABGGTBP53611 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RABGGTBP53611 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RABGGTBP53611 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RABGGTBP53611 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RABGGTBP53611 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RABGGTBP53611 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RABGGTBP53611 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RABGGTBP53611 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RABGGTBP53611 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RABGGTBP53611 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RABGGTBP53611 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RABGGTBP53611 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RABGGTBP53611 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RABGGTBP53611 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RABGGTBP53611 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RABGGTBP53611 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RABGGTBP53611 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RABGGTBP53611 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RABGGTBP53611 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RABGGTBP53611 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RABGGTBP53611 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RABGGTBP53611 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RABGGTBP53611 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RABGGTBP53611 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RABGGTBP53611 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RABGGTBP53611 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RABGGTBP53611 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RABGGTBP53611 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RABGGTBP53611 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RABGGTBP53611 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RABGGTBP53611 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RABGGTBP53611 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RABGGTBP53611 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RABGGTBP53611 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RABGGTBP53611 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RABGGTBP53611 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RABGGTBP53611 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RABGGTBP53611 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RABGGTBP53611 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RABGGTBP53611 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RABGGTBP53611 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RABGGTBP53611 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RABGGTBP53611 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RABGGTBP53611 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RABGGTBP53611 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RABGGTBP53611 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RABGGTBP53611 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RABGGTBP53611 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RABGGTBP53611 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RABGGTBP53611 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RABGGTBP53611 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RABGGTBP53611 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RABGGTBP53611 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RABGGTBP53611 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RABGGTBP53611 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RABGGTBP53611 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RABGGTBP53611 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms