Protein–RNA interactions for Protein: P53330

RTT102, Regulator of Ty1 transposition protein 102, yeastyeast

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTT102P53330 YDL183CYDL183C 963 nt4.6□□□□□ -1.67
RTT102P53330 API2YDR525W 330 nt4.6□□□□□ -1.67
RTT102P53330 ACT1YFL039C 1128 nt4.6□□□□□ -1.67
RTT102P53330 RMR1YGL250W 726 nt4.6□□□□□ -1.67
RTT102P53330 RFU1YLR073C 603 nt4.6□□□□□ -1.67
RTT102P53330 YLR407WYLR407W 687 nt4.6□□□□□ -1.67
RTT102P53330 MRP21YBL090W 534 nt4.6□□□□□ -1.67
RTT102P53330 HUL4YJR036C 2679 nt4.6□□□□□ -1.67
RTT102P53330 ECM32YER176W 3366 nt4.6□□□□□ -1.67
RTT102P53330 KIN2YLR096W 3444 nt4.6□□□□□ -1.67
RTT102P53330 TIP20YGL145W 2106 nt4.6□□□□□ -1.67
RTT102P53330 TMA17YDL110C 453 nt4.59□□□□□ -1.67
RTT102P53330 RKM2YDR198C 1440 nt4.59□□□□□ -1.67
RTT102P53330 ARG4YHR018C 1392 nt4.59□□□□□ -1.67
RTT102P53330 IMA3YIL172C 1770 nt4.59□□□□□ -1.67
RTT102P53330 IMA4YJL221C 1770 nt4.59□□□□□ -1.67
RTT102P53330 PAH1YMR165C 2589 nt4.59□□□□□ -1.67
RTT102P53330 YDL109CYDL109C 1944 nt4.58□□□□□ -1.68
RTT102P53330 VPS36YLR417W 1701 nt4.58□□□□□ -1.68
RTT102P53330 DHH1YDL160C 1521 nt4.58□□□□□ -1.68
RTT102P53330 DPB4YDR121W 591 nt4.58□□□□□ -1.68
RTT102P53330 BUD25YER014C-A 462 nt4.58□□□□□ -1.68
RTT102P53330 SPC34YKR037C 888 nt4.58□□□□□ -1.68
RTT102P53330 MDY2YOL111C 639 nt4.58□□□□□ -1.68
RTT102P53330 VPS68YOL129W 555 nt4.58□□□□□ -1.68
RTT102P53330 YPL073CYPL073C 486 nt4.58□□□□□ -1.68
RTT102P53330 ARC40YBR234C 1155 nt4.58□□□□□ -1.68
RTT102P53330 SET4YJL105W 1683 nt4.57□□□□□ -1.68
RTT102P53330 PHO90YJL198W 2646 nt4.57□□□□□ -1.68
RTT102P53330 YJL215CYJL215C 360 nt4.57□□□□□ -1.68
RTT102P53330 BOP2YLR267W 1713 nt4.57□□□□□ -1.68
RTT102P53330 NUP2YLR335W 2163 nt4.57□□□□□ -1.68
RTT102P53330 FAA3YIL009W 2085 nt4.57□□□□□ -1.68
RTT102P53330 MAL13YGR288W 1422 nt4.56□□□□□ -1.68
RTT102P53330 RAD52YML032C 1416 nt4.56□□□□□ -1.68
RTT102P53330 SEO1YAL067C 1782 nt4.56□□□□□ -1.68
RTT102P53330 TRM11YOL124C 1302 nt4.56□□□□□ -1.68
RTT102P53330 PGM2YMR105C 1710 nt4.56□□□□□ -1.68
RTT102P53330 RPC53YDL150W 1269 nt4.56□□□□□ -1.68
RTT102P53330 YGL262WYGL262W 528 nt4.56□□□□□ -1.68
RTT102P53330 GPP1YIL053W 753 nt4.56□□□□□ -1.68
RTT102P53330 EFB1YAL003W 621 nt4.56□□□□□ -1.68
RTT102P53330 YKR075CYKR075C 924 nt4.56□□□□□ -1.68
RTT102P53330 YLR124WYLR124W 345 nt4.56□□□□□ -1.68
RTT102P53330 CDC42YLR229C 576 nt4.56□□□□□ -1.68
RTT102P53330 YIM1YMR152W 1098 nt4.56□□□□□ -1.68
RTT102P53330 YNL143CYNL143C 393 nt4.56□□□□□ -1.68
RTT102P53330 snR19snR19 568 nt4.56□□□□□ -1.68
RTT102P53330 ASK10YGR097W 3441 nt4.56□□□□□ -1.68
RTT102P53330 STP4YDL048C 1473 nt4.56□□□□□ -1.68
RTT102P53330 MSK1YNL073W 1731 nt4.55□□□□□ -1.68
RTT102P53330 TRE1YPL176C 2352 nt4.55□□□□□ -1.68
RTT102P53330 TVP38YKR088C 1014 nt4.55□□□□□ -1.68
RTT102P53330 RPS0BYLR048W 759 nt4.55□□□□□ -1.68
RTT102P53330 YLR125WYLR125W 411 nt4.55□□□□□ -1.68
RTT102P53330 MRPL3YMR024W 1173 nt4.55□□□□□ -1.68
RTT102P53330 NCE103YNL036W 666 nt4.55□□□□□ -1.68
RTT102P53330 YOR131CYOR131C 657 nt4.55□□□□□ -1.68
RTT102P53330 FLC1YPL221W 2382 nt4.54□□□□□ -1.68
RTT102P53330 STB2YMR053C 2553 nt4.54□□□□□ -1.68
RTT102P53330 BUD13YGL174W 801 nt4.54□□□□□ -1.68
RTT102P53330 ECT1YGR007W 972 nt4.54□□□□□ -1.68
RTT102P53330 YLL017WYLL017W 312 nt4.54□□□□□ -1.68
RTT102P53330 YMR082CYMR082C 357 nt4.54□□□□□ -1.68
RTT102P53330 NAT5YOR253W 531 nt4.54□□□□□ -1.68
RTT102P53330 YBR196C-BYBR196C-B 105 nt4.54□□□□□ -1.68
RTT102P53330 GWT1YJL091C 1473 nt4.54□□□□□ -1.68
RTT102P53330 EKI1YDR147W 1605 nt4.54□□□□□ -1.68
RTT102P53330 MST1YKL194C 1389 nt4.53□□□□□ -1.68
RTT102P53330 MEF2YJL102W 2460 nt4.53□□□□□ -1.68
RTT102P53330 YDL228CYDL228C 642 nt4.53□□□□□ -1.68
RTT102P53330 UBC1YDR177W 648 nt4.53□□□□□ -1.68
RTT102P53330 MIC26YGR235C 702 nt4.53□□□□□ -1.68
RTT102P53330 DSE3YOR264W 1293 nt4.53□□□□□ -1.68
RTT102P53330 OPY2YPR075C 1083 nt4.53□□□□□ -1.68
RTT102P53330 SRB6YBR253W 366 nt4.53□□□□□ -1.68
RTT102P53330 FKH1YIL131C 1455 nt4.53□□□□□ -1.68
RTT102P53330 BLM10YFL007W 6432 nt4.53□□□□□ -1.68
RTT102P53330 MET4YNL103W 2019 nt4.53□□□□□ -1.68
RTT102P53330 NNK1YKL171W 2787 nt4.53□□□□□ -1.68
RTT102P53330 ADP1YCR011C 3150 nt4.52□□□□□ -1.69
RTT102P53330 SPC105YGL093W 2754 nt4.52□□□□□ -1.69
RTT102P53330 MPH2YDL247W 1830 nt4.52□□□□□ -1.69
RTT102P53330 YER147C-AYER147C-A 411 nt4.52□□□□□ -1.69
RTT102P53330 tQ(UUG)CtQ(UUG)C 72 nt4.52□□□□□ -1.69
RTT102P53330 tQ(UUG)D1tQ(UUG)D1 72 nt4.52□□□□□ -1.69
RTT102P53330 tQ(UUG)D2tQ(UUG)D2 72 nt4.52□□□□□ -1.69
RTT102P53330 tQ(UUG)D3tQ(UUG)D3 72 nt4.52□□□□□ -1.69
RTT102P53330 tQ(UUG)E1tQ(UUG)E1 72 nt4.52□□□□□ -1.69
RTT102P53330 tQ(UUG)HtQ(UUG)H 72 nt4.52□□□□□ -1.69
RTT102P53330 tQ(UUG)LtQ(UUG)L 72 nt4.52□□□□□ -1.69
RTT102P53330 YIL171WYIL171W 330 nt4.52□□□□□ -1.69
RTT102P53330 YLR036CYLR036C 612 nt4.52□□□□□ -1.69
RTT102P53330 COG5YNL051W 1212 nt4.52□□□□□ -1.69
RTT102P53330 ISA2YPR067W 558 nt4.52□□□□□ -1.69
RTT102P53330 SKM1YOL113W 1968 nt4.51□□□□□ -1.69
RTT102P53330 YDR246W-AYDR246W-A 201 nt4.51□□□□□ -1.69
RTT102P53330 ARC1YGL105W 1131 nt4.51□□□□□ -1.69
RTT102P53330 RAD27YKL113C 1149 nt4.51□□□□□ -1.69
RTT102P53330 MRPL20YKR085C 588 nt4.51□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 28.9 ms