Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
NUP98P52948 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NUP98P52948 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NUP98P52948 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NUP98P52948 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NUP98P52948 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NUP98P52948 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NUP98P52948 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NUP98P52948 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NUP98P52948 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NUP98P52948 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUP98P52948 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUP98P52948 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUP98P52948 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
NUP98P52948 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUP98P52948 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUP98P52948 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUP98P52948 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUP98P52948 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUP98P52948 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUP98P52948 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUP98P52948 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
NUP98P52948 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUP98P52948 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUP98P52948 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUP98P52948 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUP98P52948 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUP98P52948 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUP98P52948 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUP98P52948 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUP98P52948 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
NUP98P52948 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUP98P52948 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUP98P52948 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUP98P52948 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUP98P52948 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUP98P52948 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUP98P52948 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
NUP98P52948 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUP98P52948 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NUP98P52948 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NUP98P52948 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NUP98P52948 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
NUP98P52948 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NUP98P52948 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NUP98P52948 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NUP98P52948 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NUP98P52948 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NUP98P52948 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NUP98P52948 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NUP98P52948 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NUP98P52948 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NUP98P52948 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NUP98P52948 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NUP98P52948 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NUP98P52948 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NUP98P52948 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NUP98P52948 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NUP98P52948 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NUP98P52948 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NUP98P52948 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NUP98P52948 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NUP98P52948 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NUP98P52948 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NUP98P52948 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NUP98P52948 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NUP98P52948 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NUP98P52948 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NUP98P52948 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NUP98P52948 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NUP98P52948 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NUP98P52948 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NUP98P52948 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NUP98P52948 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
NUP98P52948 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NUP98P52948 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NUP98P52948 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NUP98P52948 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NUP98P52948 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NUP98P52948 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
NUP98P52948 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NUP98P52948 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
NUP98P52948 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NUP98P52948 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NUP98P52948 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NUP98P52948 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NUP98P52948 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUP98P52948 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUP98P52948 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUP98P52948 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUP98P52948 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUP98P52948 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
NUP98P52948 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUP98P52948 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUP98P52948 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUP98P52948 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUP98P52948 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NUP98P52948 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NUP98P52948 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
NUP98P52948 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms