Protein–RNA interactions for Protein: P52306

RAP1GDS1, Rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAP1GDS1P52306 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAP1GDS1P52306 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAP1GDS1P52306 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAP1GDS1P52306 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAP1GDS1P52306 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAP1GDS1P52306 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAP1GDS1P52306 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAP1GDS1P52306 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAP1GDS1P52306 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAP1GDS1P52306 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAP1GDS1P52306 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAP1GDS1P52306 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAP1GDS1P52306 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAP1GDS1P52306 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAP1GDS1P52306 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAP1GDS1P52306 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAP1GDS1P52306 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAP1GDS1P52306 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAP1GDS1P52306 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAP1GDS1P52306 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAP1GDS1P52306 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAP1GDS1P52306 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAP1GDS1P52306 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAP1GDS1P52306 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAP1GDS1P52306 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAP1GDS1P52306 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAP1GDS1P52306 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAP1GDS1P52306 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAP1GDS1P52306 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAP1GDS1P52306 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RAP1GDS1P52306 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAP1GDS1P52306 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAP1GDS1P52306 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAP1GDS1P52306 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAP1GDS1P52306 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAP1GDS1P52306 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAP1GDS1P52306 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAP1GDS1P52306 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAP1GDS1P52306 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAP1GDS1P52306 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAP1GDS1P52306 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAP1GDS1P52306 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAP1GDS1P52306 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAP1GDS1P52306 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAP1GDS1P52306 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAP1GDS1P52306 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAP1GDS1P52306 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAP1GDS1P52306 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAP1GDS1P52306 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAP1GDS1P52306 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAP1GDS1P52306 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAP1GDS1P52306 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAP1GDS1P52306 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAP1GDS1P52306 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAP1GDS1P52306 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAP1GDS1P52306 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAP1GDS1P52306 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAP1GDS1P52306 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAP1GDS1P52306 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAP1GDS1P52306 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAP1GDS1P52306 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAP1GDS1P52306 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RAP1GDS1P52306 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAP1GDS1P52306 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAP1GDS1P52306 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAP1GDS1P52306 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAP1GDS1P52306 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAP1GDS1P52306 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAP1GDS1P52306 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAP1GDS1P52306 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAP1GDS1P52306 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAP1GDS1P52306 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAP1GDS1P52306 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAP1GDS1P52306 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAP1GDS1P52306 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAP1GDS1P52306 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAP1GDS1P52306 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAP1GDS1P52306 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAP1GDS1P52306 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RAP1GDS1P52306 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RAP1GDS1P52306 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAP1GDS1P52306 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAP1GDS1P52306 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAP1GDS1P52306 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAP1GDS1P52306 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RAP1GDS1P52306 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAP1GDS1P52306 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAP1GDS1P52306 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAP1GDS1P52306 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAP1GDS1P52306 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAP1GDS1P52306 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAP1GDS1P52306 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAP1GDS1P52306 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAP1GDS1P52306 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RAP1GDS1P52306 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAP1GDS1P52306 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAP1GDS1P52306 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAP1GDS1P52306 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RAP1GDS1P52306 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RAP1GDS1P52306 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms