Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.58■■■■■ 4.09
SMARCA2P51531 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
SMARCA2P51531 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC40.58■■■■■ 4.09
SMARCA2P51531 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC40.58■■■■■ 4.09
SMARCA2P51531 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC40.58■■■■■ 4.09
SMARCA2P51531 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC40.57■■■■■ 4.09
SMARCA2P51531 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
SMARCA2P51531 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
SMARCA2P51531 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC40.57■■■■■ 4.08
SMARCA2P51531 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC40.57■■■■■ 4.08
SMARCA2P51531 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC40.57■■■■■ 4.08
SMARCA2P51531 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC40.57■■■■■ 4.08
SMARCA2P51531 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC40.57■■■■■ 4.08
SMARCA2P51531 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC40.57■■■■■ 4.08
SMARCA2P51531 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC40.57■■■■■ 4.08
SMARCA2P51531 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC40.56■■■■■ 4.08
SMARCA2P51531 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC40.56■■■■■ 4.08
SMARCA2P51531 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC40.56■■■■■ 4.08
SMARCA2P51531 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC40.56■■■■■ 4.08
SMARCA2P51531 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC40.56■■■■■ 4.08
SMARCA2P51531 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC40.56■■■■■ 4.08
SMARCA2P51531 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
SMARCA2P51531 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.55■■■■■ 4.08
SMARCA2P51531 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC40.55■■■■■ 4.08
SMARCA2P51531 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
SMARCA2P51531 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC40.55■■■■■ 4.08
SMARCA2P51531 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC40.55■■■■■ 4.08
SMARCA2P51531 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC40.55■■■■■ 4.08
SMARCA2P51531 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC40.54■■■■■ 4.08
SMARCA2P51531 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
SMARCA2P51531 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.54■■■■■ 4.08
SMARCA2P51531 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC40.54■■■■■ 4.08
SMARCA2P51531 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.54■■■■■ 4.08
SMARCA2P51531 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.54■■■■■ 4.08
SMARCA2P51531 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.54■■■■■ 4.08
SMARCA2P51531 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
SMARCA2P51531 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
SMARCA2P51531 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.53■■■■■ 4.08
SMARCA2P51531 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
SMARCA2P51531 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC40.53■■■■■ 4.08
SMARCA2P51531 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
SMARCA2P51531 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC40.52■■■■■ 4.08
SMARCA2P51531 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC40.52■■■■■ 4.08
SMARCA2P51531 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC40.52■■■■■ 4.08
SMARCA2P51531 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
SMARCA2P51531 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
SMARCA2P51531 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC40.52■■■■■ 4.08
SMARCA2P51531 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC40.52■■■■■ 4.08
SMARCA2P51531 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
SMARCA2P51531 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC40.52■■■■■ 4.08
SMARCA2P51531 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
SMARCA2P51531 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC40.52■■■■■ 4.08
SMARCA2P51531 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC40.52■■■■■ 4.08
SMARCA2P51531 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC40.52■■■■■ 4.08
SMARCA2P51531 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
SMARCA2P51531 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
SMARCA2P51531 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC40.51■■■■■ 4.08
SMARCA2P51531 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
SMARCA2P51531 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.07
SMARCA2P51531 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC40.5■■■■■ 4.07
SMARCA2P51531 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC40.5■■■■■ 4.07
SMARCA2P51531 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
SMARCA2P51531 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC40.5■■■■■ 4.07
SMARCA2P51531 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
SMARCA2P51531 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
SMARCA2P51531 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC40.49■■■■■ 4.07
SMARCA2P51531 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
SMARCA2P51531 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC40.48■■■■■ 4.07
SMARCA2P51531 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC40.48■■■■■ 4.07
SMARCA2P51531 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
SMARCA2P51531 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC40.48■■■■■ 4.07
SMARCA2P51531 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC40.48■■■■■ 4.07
SMARCA2P51531 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC40.48■■■■■ 4.07
SMARCA2P51531 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
SMARCA2P51531 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
SMARCA2P51531 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.47■■■■■ 4.07
SMARCA2P51531 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
SMARCA2P51531 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC40.46■■■■■ 4.07
SMARCA2P51531 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC40.46■■■■■ 4.07
SMARCA2P51531 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC40.46■■■■■ 4.07
SMARCA2P51531 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC40.45■■■■■ 4.07
SMARCA2P51531 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
SMARCA2P51531 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.45■■■■■ 4.07
SMARCA2P51531 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
SMARCA2P51531 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
SMARCA2P51531 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.45■■■■■ 4.07
SMARCA2P51531 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC40.44■■■■■ 4.06
SMARCA2P51531 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
SMARCA2P51531 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.44■■■■■ 4.06
SMARCA2P51531 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC40.44■■■■■ 4.06
SMARCA2P51531 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
SMARCA2P51531 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
SMARCA2P51531 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC40.43■■■■■ 4.06
SMARCA2P51531 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC40.43■■■■■ 4.06
SMARCA2P51531 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC40.43■■■■■ 4.06
SMARCA2P51531 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
SMARCA2P51531 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC40.42■■■■■ 4.06
SMARCA2P51531 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC40.42■■■■■ 4.06
SMARCA2P51531 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
SMARCA2P51531 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms