Protein–RNA interactions for Protein: P51160

PDE6C, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6CP51160 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE6CP51160 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE6CP51160 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE6CP51160 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE6CP51160 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE6CP51160 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE6CP51160 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE6CP51160 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE6CP51160 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE6CP51160 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE6CP51160 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE6CP51160 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE6CP51160 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE6CP51160 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE6CP51160 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE6CP51160 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE6CP51160 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE6CP51160 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE6CP51160 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE6CP51160 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE6CP51160 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE6CP51160 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE6CP51160 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE6CP51160 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE6CP51160 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PDE6CP51160 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PDE6CP51160 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PDE6CP51160 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PDE6CP51160 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE6CP51160 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE6CP51160 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE6CP51160 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE6CP51160 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE6CP51160 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE6CP51160 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE6CP51160 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE6CP51160 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE6CP51160 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE6CP51160 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE6CP51160 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE6CP51160 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE6CP51160 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE6CP51160 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE6CP51160 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE6CP51160 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE6CP51160 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE6CP51160 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE6CP51160 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE6CP51160 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE6CP51160 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE6CP51160 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE6CP51160 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE6CP51160 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE6CP51160 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE6CP51160 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE6CP51160 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE6CP51160 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE6CP51160 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE6CP51160 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE6CP51160 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE6CP51160 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE6CP51160 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE6CP51160 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE6CP51160 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE6CP51160 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE6CP51160 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE6CP51160 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE6CP51160 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE6CP51160 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE6CP51160 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE6CP51160 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE6CP51160 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE6CP51160 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE6CP51160 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE6CP51160 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE6CP51160 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE6CP51160 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE6CP51160 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE6CP51160 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE6CP51160 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE6CP51160 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE6CP51160 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE6CP51160 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE6CP51160 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE6CP51160 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE6CP51160 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE6CP51160 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE6CP51160 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE6CP51160 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE6CP51160 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE6CP51160 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE6CP51160 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE6CP51160 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE6CP51160 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE6CP51160 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE6CP51160 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE6CP51160 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE6CP51160 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE6CP51160 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE6CP51160 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms