Protein–RNA interactions for Protein: P50613

CDK7, Cyclin-dependent kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK7P50613 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
CDK7P50613 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CDK7P50613 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CDK7P50613 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CDK7P50613 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK7P50613 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK7P50613 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK7P50613 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK7P50613 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK7P50613 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK7P50613 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK7P50613 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK7P50613 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK7P50613 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK7P50613 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK7P50613 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK7P50613 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK7P50613 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK7P50613 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK7P50613 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK7P50613 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK7P50613 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK7P50613 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK7P50613 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK7P50613 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK7P50613 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK7P50613 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK7P50613 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK7P50613 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK7P50613 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK7P50613 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK7P50613 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK7P50613 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK7P50613 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK7P50613 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK7P50613 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK7P50613 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK7P50613 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK7P50613 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK7P50613 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK7P50613 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK7P50613 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK7P50613 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK7P50613 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK7P50613 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK7P50613 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK7P50613 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK7P50613 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK7P50613 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK7P50613 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK7P50613 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK7P50613 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK7P50613 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK7P50613 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK7P50613 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK7P50613 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK7P50613 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK7P50613 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK7P50613 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK7P50613 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDK7P50613 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDK7P50613 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDK7P50613 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDK7P50613 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDK7P50613 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDK7P50613 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDK7P50613 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDK7P50613 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDK7P50613 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDK7P50613 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK7P50613 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK7P50613 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK7P50613 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK7P50613 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK7P50613 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK7P50613 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK7P50613 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK7P50613 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK7P50613 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK7P50613 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK7P50613 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK7P50613 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK7P50613 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK7P50613 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK7P50613 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK7P50613 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK7P50613 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK7P50613 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK7P50613 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK7P50613 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK7P50613 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK7P50613 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK7P50613 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK7P50613 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK7P50613 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK7P50613 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK7P50613 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK7P50613 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK7P50613 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK7P50613 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152.4 ms