Protein–RNA interactions for Protein: P50607

TUB, Tubby protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBP50607 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBP50607 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBP50607 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBP50607 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBP50607 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBP50607 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBP50607 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBP50607 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBP50607 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBP50607 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBP50607 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBP50607 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBP50607 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBP50607 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBP50607 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBP50607 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBP50607 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBP50607 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBP50607 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBP50607 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBP50607 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBP50607 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBP50607 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBP50607 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBP50607 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBP50607 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBP50607 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBP50607 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBP50607 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBP50607 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBP50607 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBP50607 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBP50607 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBP50607 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBP50607 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBP50607 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBP50607 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBP50607 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBP50607 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBP50607 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBP50607 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBP50607 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBP50607 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBP50607 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBP50607 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBP50607 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBP50607 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBP50607 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBP50607 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBP50607 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBP50607 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBP50607 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBP50607 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBP50607 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBP50607 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBP50607 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBP50607 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBP50607 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBP50607 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBP50607 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBP50607 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBP50607 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBP50607 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBP50607 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBP50607 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBP50607 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBP50607 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBP50607 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBP50607 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBP50607 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBP50607 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBP50607 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBP50607 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBP50607 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBP50607 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBP50607 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBP50607 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBP50607 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBP50607 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBP50607 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBP50607 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBP50607 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBP50607 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBP50607 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBP50607 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBP50607 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBP50607 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBP50607 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBP50607 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBP50607 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBP50607 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBP50607 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBP50607 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBP50607 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBP50607 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBP50607 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBP50607 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBP50607 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBP50607 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBP50607 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms