Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASP4P49662 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASP4P49662 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASP4P49662 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASP4P49662 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASP4P49662 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASP4P49662 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASP4P49662 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASP4P49662 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASP4P49662 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASP4P49662 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASP4P49662 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASP4P49662 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASP4P49662 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASP4P49662 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASP4P49662 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASP4P49662 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CASP4P49662 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASP4P49662 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASP4P49662 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASP4P49662 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASP4P49662 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASP4P49662 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASP4P49662 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASP4P49662 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASP4P49662 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASP4P49662 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASP4P49662 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASP4P49662 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASP4P49662 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASP4P49662 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASP4P49662 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASP4P49662 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASP4P49662 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CASP4P49662 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASP4P49662 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CASP4P49662 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASP4P49662 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASP4P49662 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASP4P49662 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASP4P49662 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASP4P49662 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASP4P49662 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASP4P49662 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASP4P49662 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASP4P49662 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASP4P49662 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASP4P49662 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASP4P49662 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASP4P49662 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASP4P49662 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CASP4P49662 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CASP4P49662 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CASP4P49662 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CASP4P49662 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CASP4P49662 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CASP4P49662 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CASP4P49662 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CASP4P49662 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASP4P49662 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASP4P49662 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASP4P49662 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CASP4P49662 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASP4P49662 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASP4P49662 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASP4P49662 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CASP4P49662 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CASP4P49662 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CASP4P49662 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CASP4P49662 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CASP4P49662 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASP4P49662 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASP4P49662 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASP4P49662 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASP4P49662 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASP4P49662 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASP4P49662 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASP4P49662 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASP4P49662 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASP4P49662 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASP4P49662 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASP4P49662 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASP4P49662 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASP4P49662 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASP4P49662 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CASP4P49662 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CASP4P49662 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CASP4P49662 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CASP4P49662 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CASP4P49662 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CASP4P49662 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CASP4P49662 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CASP4P49662 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CASP4P49662 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CASP4P49662 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CASP4P49662 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CASP4P49662 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CASP4P49662 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CASP4P49662 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CASP4P49662 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms