Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CENPFP49454 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CENPFP49454 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CENPFP49454 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CENPFP49454 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CENPFP49454 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CENPFP49454 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CENPFP49454 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CENPFP49454 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CENPFP49454 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CENPFP49454 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CENPFP49454 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CENPFP49454 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CENPFP49454 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CENPFP49454 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CENPFP49454 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CENPFP49454 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CENPFP49454 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CENPFP49454 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CENPFP49454 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CENPFP49454 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CENPFP49454 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CENPFP49454 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CENPFP49454 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CENPFP49454 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CENPFP49454 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CENPFP49454 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CENPFP49454 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CENPFP49454 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CENPFP49454 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CENPFP49454 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CENPFP49454 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CENPFP49454 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CENPFP49454 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CENPFP49454 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CENPFP49454 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CENPFP49454 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CENPFP49454 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CENPFP49454 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CENPFP49454 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CENPFP49454 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CENPFP49454 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CENPFP49454 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CENPFP49454 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CENPFP49454 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CENPFP49454 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CENPFP49454 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CENPFP49454 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CENPFP49454 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CENPFP49454 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CENPFP49454 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CENPFP49454 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CENPFP49454 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CENPFP49454 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CENPFP49454 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CENPFP49454 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CENPFP49454 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CENPFP49454 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CENPFP49454 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
CENPFP49454 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CENPFP49454 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CENPFP49454 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CENPFP49454 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CENPFP49454 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CENPFP49454 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CENPFP49454 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CENPFP49454 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CENPFP49454 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CENPFP49454 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CENPFP49454 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CENPFP49454 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CENPFP49454 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CENPFP49454 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CENPFP49454 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CENPFP49454 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CENPFP49454 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CENPFP49454 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CENPFP49454 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CENPFP49454 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CENPFP49454 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CENPFP49454 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CENPFP49454 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CENPFP49454 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CENPFP49454 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CENPFP49454 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CENPFP49454 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CENPFP49454 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CENPFP49454 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CENPFP49454 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CENPFP49454 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CENPFP49454 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CENPFP49454 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CENPFP49454 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CENPFP49454 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CENPFP49454 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CENPFP49454 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CENPFP49454 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CENPFP49454 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CENPFP49454 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CENPFP49454 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms