Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CENPAP49450 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CENPAP49450 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CENPAP49450 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CENPAP49450 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CENPAP49450 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CENPAP49450 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CENPAP49450 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CENPAP49450 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CENPAP49450 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CENPAP49450 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CENPAP49450 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CENPAP49450 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPAP49450 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPAP49450 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPAP49450 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPAP49450 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPAP49450 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPAP49450 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPAP49450 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPAP49450 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPAP49450 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPAP49450 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPAP49450 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPAP49450 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPAP49450 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPAP49450 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPAP49450 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CENPAP49450 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CENPAP49450 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPAP49450 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPAP49450 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPAP49450 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPAP49450 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPAP49450 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPAP49450 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPAP49450 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPAP49450 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPAP49450 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPAP49450 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPAP49450 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPAP49450 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPAP49450 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPAP49450 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPAP49450 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPAP49450 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPAP49450 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPAP49450 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPAP49450 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPAP49450 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPAP49450 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPAP49450 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPAP49450 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPAP49450 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPAP49450 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPAP49450 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPAP49450 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPAP49450 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPAP49450 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPAP49450 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPAP49450 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPAP49450 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPAP49450 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPAP49450 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPAP49450 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPAP49450 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPAP49450 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPAP49450 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPAP49450 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPAP49450 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPAP49450 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPAP49450 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPAP49450 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPAP49450 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPAP49450 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPAP49450 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPAP49450 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPAP49450 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPAP49450 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPAP49450 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPAP49450 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPAP49450 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPAP49450 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPAP49450 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPAP49450 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPAP49450 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPAP49450 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPAP49450 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPAP49450 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPAP49450 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPAP49450 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPAP49450 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPAP49450 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPAP49450 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPAP49450 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPAP49450 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPAP49450 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPAP49450 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPAP49450 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPAP49450 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms