Protein–RNA interactions for Protein: P43357

MAGEA3, Melanoma-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA3P43357 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAGEA3P43357 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
MAGEA3P43357 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MAGEA3P43357 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MAGEA3P43357 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MAGEA3P43357 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MAGEA3P43357 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MAGEA3P43357 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MAGEA3P43357 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MAGEA3P43357 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MAGEA3P43357 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MAGEA3P43357 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MAGEA3P43357 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MAGEA3P43357 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MAGEA3P43357 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MAGEA3P43357 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MAGEA3P43357 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MAGEA3P43357 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MAGEA3P43357 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MAGEA3P43357 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MAGEA3P43357 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MAGEA3P43357 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MAGEA3P43357 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MAGEA3P43357 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MAGEA3P43357 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MAGEA3P43357 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MAGEA3P43357 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MAGEA3P43357 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MAGEA3P43357 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAGEA3P43357 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAGEA3P43357 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAGEA3P43357 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAGEA3P43357 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MAGEA3P43357 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAGEA3P43357 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAGEA3P43357 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAGEA3P43357 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MAGEA3P43357 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MAGEA3P43357 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MAGEA3P43357 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MAGEA3P43357 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MAGEA3P43357 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MAGEA3P43357 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MAGEA3P43357 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MAGEA3P43357 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MAGEA3P43357 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MAGEA3P43357 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MAGEA3P43357 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MAGEA3P43357 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MAGEA3P43357 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MAGEA3P43357 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MAGEA3P43357 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MAGEA3P43357 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MAGEA3P43357 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MAGEA3P43357 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MAGEA3P43357 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MAGEA3P43357 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MAGEA3P43357 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MAGEA3P43357 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MAGEA3P43357 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MAGEA3P43357 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MAGEA3P43357 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MAGEA3P43357 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MAGEA3P43357 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MAGEA3P43357 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MAGEA3P43357 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MAGEA3P43357 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MAGEA3P43357 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MAGEA3P43357 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MAGEA3P43357 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MAGEA3P43357 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MAGEA3P43357 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MAGEA3P43357 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MAGEA3P43357 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MAGEA3P43357 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MAGEA3P43357 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MAGEA3P43357 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MAGEA3P43357 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MAGEA3P43357 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MAGEA3P43357 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MAGEA3P43357 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MAGEA3P43357 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MAGEA3P43357 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MAGEA3P43357 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MAGEA3P43357 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MAGEA3P43357 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MAGEA3P43357 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MAGEA3P43357 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MAGEA3P43357 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MAGEA3P43357 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MAGEA3P43357 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MAGEA3P43357 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MAGEA3P43357 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MAGEA3P43357 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MAGEA3P43357 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MAGEA3P43357 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MAGEA3P43357 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MAGEA3P43357 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MAGEA3P43357 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MAGEA3P43357 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms