Protein–RNA interactions for Protein: P43354

NR4A2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A2P43354 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NR4A2P43354 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NR4A2P43354 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NR4A2P43354 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NR4A2P43354 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NR4A2P43354 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NR4A2P43354 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NR4A2P43354 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NR4A2P43354 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NR4A2P43354 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NR4A2P43354 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NR4A2P43354 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NR4A2P43354 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NR4A2P43354 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NR4A2P43354 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NR4A2P43354 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NR4A2P43354 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NR4A2P43354 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NR4A2P43354 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NR4A2P43354 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NR4A2P43354 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NR4A2P43354 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NR4A2P43354 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NR4A2P43354 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NR4A2P43354 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NR4A2P43354 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NR4A2P43354 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NR4A2P43354 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NR4A2P43354 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NR4A2P43354 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NR4A2P43354 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NR4A2P43354 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NR4A2P43354 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NR4A2P43354 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NR4A2P43354 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NR4A2P43354 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NR4A2P43354 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NR4A2P43354 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NR4A2P43354 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NR4A2P43354 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NR4A2P43354 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NR4A2P43354 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NR4A2P43354 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NR4A2P43354 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NR4A2P43354 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NR4A2P43354 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NR4A2P43354 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NR4A2P43354 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NR4A2P43354 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NR4A2P43354 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NR4A2P43354 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NR4A2P43354 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NR4A2P43354 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NR4A2P43354 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NR4A2P43354 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NR4A2P43354 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NR4A2P43354 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NR4A2P43354 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NR4A2P43354 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NR4A2P43354 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NR4A2P43354 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NR4A2P43354 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NR4A2P43354 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NR4A2P43354 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NR4A2P43354 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NR4A2P43354 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NR4A2P43354 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NR4A2P43354 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NR4A2P43354 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NR4A2P43354 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NR4A2P43354 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NR4A2P43354 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NR4A2P43354 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NR4A2P43354 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NR4A2P43354 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NR4A2P43354 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NR4A2P43354 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NR4A2P43354 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NR4A2P43354 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NR4A2P43354 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NR4A2P43354 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NR4A2P43354 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NR4A2P43354 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NR4A2P43354 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NR4A2P43354 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NR4A2P43354 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NR4A2P43354 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NR4A2P43354 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NR4A2P43354 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
NR4A2P43354 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NR4A2P43354 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NR4A2P43354 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NR4A2P43354 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NR4A2P43354 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NR4A2P43354 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NR4A2P43354 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NR4A2P43354 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NR4A2P43354 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NR4A2P43354 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NR4A2P43354 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms