Protein–RNA interactions for Protein: P43268

ETV4, ETS translocation variant 4, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV4P43268 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ETV4P43268 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ETV4P43268 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ETV4P43268 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ETV4P43268 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ETV4P43268 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ETV4P43268 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ETV4P43268 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ETV4P43268 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ETV4P43268 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ETV4P43268 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ETV4P43268 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ETV4P43268 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ETV4P43268 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ETV4P43268 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ETV4P43268 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ETV4P43268 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ETV4P43268 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ETV4P43268 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ETV4P43268 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ETV4P43268 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ETV4P43268 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ETV4P43268 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ETV4P43268 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ETV4P43268 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ETV4P43268 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ETV4P43268 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ETV4P43268 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ETV4P43268 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ETV4P43268 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ETV4P43268 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ETV4P43268 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ETV4P43268 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ETV4P43268 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ETV4P43268 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ETV4P43268 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ETV4P43268 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ETV4P43268 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ETV4P43268 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ETV4P43268 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ETV4P43268 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ETV4P43268 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ETV4P43268 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ETV4P43268 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ETV4P43268 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ETV4P43268 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ETV4P43268 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ETV4P43268 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ETV4P43268 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ETV4P43268 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ETV4P43268 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ETV4P43268 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ETV4P43268 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ETV4P43268 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ETV4P43268 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ETV4P43268 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ETV4P43268 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ETV4P43268 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ETV4P43268 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ETV4P43268 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ETV4P43268 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ETV4P43268 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ETV4P43268 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ETV4P43268 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ETV4P43268 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ETV4P43268 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ETV4P43268 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ETV4P43268 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ETV4P43268 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ETV4P43268 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ETV4P43268 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ETV4P43268 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ETV4P43268 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ETV4P43268 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ETV4P43268 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ETV4P43268 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ETV4P43268 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ETV4P43268 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ETV4P43268 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ETV4P43268 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ETV4P43268 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ETV4P43268 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ETV4P43268 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ETV4P43268 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ETV4P43268 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ETV4P43268 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ETV4P43268 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ETV4P43268 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ETV4P43268 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ETV4P43268 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ETV4P43268 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ETV4P43268 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ETV4P43268 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ETV4P43268 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ETV4P43268 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ETV4P43268 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ETV4P43268 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ETV4P43268 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ETV4P43268 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ETV4P43268 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms