Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIA2P42262 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIA2P42262 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIA2P42262 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIA2P42262 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIA2P42262 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIA2P42262 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIA2P42262 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIA2P42262 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIA2P42262 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIA2P42262 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIA2P42262 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIA2P42262 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIA2P42262 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIA2P42262 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIA2P42262 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIA2P42262 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIA2P42262 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIA2P42262 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIA2P42262 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIA2P42262 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIA2P42262 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIA2P42262 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIA2P42262 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GRIA2P42262 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GRIA2P42262 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GRIA2P42262 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIA2P42262 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIA2P42262 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIA2P42262 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIA2P42262 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIA2P42262 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIA2P42262 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIA2P42262 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIA2P42262 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIA2P42262 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIA2P42262 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIA2P42262 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIA2P42262 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIA2P42262 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIA2P42262 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIA2P42262 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIA2P42262 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIA2P42262 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIA2P42262 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIA2P42262 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIA2P42262 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIA2P42262 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIA2P42262 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIA2P42262 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIA2P42262 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIA2P42262 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIA2P42262 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIA2P42262 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIA2P42262 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIA2P42262 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIA2P42262 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIA2P42262 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIA2P42262 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIA2P42262 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIA2P42262 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIA2P42262 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIA2P42262 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIA2P42262 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIA2P42262 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIA2P42262 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIA2P42262 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIA2P42262 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIA2P42262 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIA2P42262 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIA2P42262 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIA2P42262 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIA2P42262 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIA2P42262 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIA2P42262 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIA2P42262 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIA2P42262 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIA2P42262 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIA2P42262 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIA2P42262 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIA2P42262 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIA2P42262 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIA2P42262 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIA2P42262 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIA2P42262 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIA2P42262 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIA2P42262 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIA2P42262 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIA2P42262 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIA2P42262 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIA2P42262 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIA2P42262 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIA2P42262 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIA2P42262 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIA2P42262 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIA2P42262 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIA2P42262 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIA2P42262 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIA2P42262 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIA2P42262 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms